Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRN9

TM2D3, TM2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM2D3Q9BRN9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TM2D3Q9BRN9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TM2D3Q9BRN9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TM2D3Q9BRN9 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TM2D3Q9BRN9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TM2D3Q9BRN9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TM2D3Q9BRN9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TM2D3Q9BRN9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TM2D3Q9BRN9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TM2D3Q9BRN9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TM2D3Q9BRN9 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TM2D3Q9BRN9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TM2D3Q9BRN9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TM2D3Q9BRN9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TM2D3Q9BRN9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TM2D3Q9BRN9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TM2D3Q9BRN9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TM2D3Q9BRN9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TM2D3Q9BRN9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TM2D3Q9BRN9 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TM2D3Q9BRN9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TM2D3Q9BRN9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TM2D3Q9BRN9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TM2D3Q9BRN9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TM2D3Q9BRN9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TM2D3Q9BRN9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TM2D3Q9BRN9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TM2D3Q9BRN9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TM2D3Q9BRN9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TM2D3Q9BRN9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TM2D3Q9BRN9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TM2D3Q9BRN9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TM2D3Q9BRN9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TM2D3Q9BRN9 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TM2D3Q9BRN9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TM2D3Q9BRN9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TM2D3Q9BRN9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TM2D3Q9BRN9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TM2D3Q9BRN9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TM2D3Q9BRN9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TM2D3Q9BRN9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TM2D3Q9BRN9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TM2D3Q9BRN9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TM2D3Q9BRN9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TM2D3Q9BRN9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TM2D3Q9BRN9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TM2D3Q9BRN9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TM2D3Q9BRN9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TM2D3Q9BRN9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TM2D3Q9BRN9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TM2D3Q9BRN9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TM2D3Q9BRN9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TM2D3Q9BRN9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TM2D3Q9BRN9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TM2D3Q9BRN9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TM2D3Q9BRN9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TM2D3Q9BRN9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TM2D3Q9BRN9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TM2D3Q9BRN9 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
TM2D3Q9BRN9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
TM2D3Q9BRN9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TM2D3Q9BRN9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TM2D3Q9BRN9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TM2D3Q9BRN9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TM2D3Q9BRN9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TM2D3Q9BRN9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TM2D3Q9BRN9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TM2D3Q9BRN9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TM2D3Q9BRN9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TM2D3Q9BRN9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TM2D3Q9BRN9 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TM2D3Q9BRN9 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TM2D3Q9BRN9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TM2D3Q9BRN9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TM2D3Q9BRN9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TM2D3Q9BRN9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TM2D3Q9BRN9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TM2D3Q9BRN9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TM2D3Q9BRN9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TM2D3Q9BRN9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TM2D3Q9BRN9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TM2D3Q9BRN9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TM2D3Q9BRN9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TM2D3Q9BRN9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TM2D3Q9BRN9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TM2D3Q9BRN9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TM2D3Q9BRN9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TM2D3Q9BRN9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TM2D3Q9BRN9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TM2D3Q9BRN9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TM2D3Q9BRN9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TM2D3Q9BRN9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TM2D3Q9BRN9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TM2D3Q9BRN9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TM2D3Q9BRN9 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TM2D3Q9BRN9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TM2D3Q9BRN9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TM2D3Q9BRN9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TM2D3Q9BRN9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TM2D3Q9BRN9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms