Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRK5

SDF4, 45 kDa calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDF4Q9BRK5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SDF4Q9BRK5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SDF4Q9BRK5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SDF4Q9BRK5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SDF4Q9BRK5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SDF4Q9BRK5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SDF4Q9BRK5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SDF4Q9BRK5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SDF4Q9BRK5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SDF4Q9BRK5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SDF4Q9BRK5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SDF4Q9BRK5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SDF4Q9BRK5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
SDF4Q9BRK5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SDF4Q9BRK5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
SDF4Q9BRK5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SDF4Q9BRK5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SDF4Q9BRK5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SDF4Q9BRK5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SDF4Q9BRK5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
SDF4Q9BRK5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SDF4Q9BRK5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SDF4Q9BRK5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SDF4Q9BRK5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SDF4Q9BRK5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SDF4Q9BRK5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SDF4Q9BRK5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SDF4Q9BRK5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SDF4Q9BRK5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SDF4Q9BRK5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SDF4Q9BRK5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SDF4Q9BRK5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SDF4Q9BRK5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SDF4Q9BRK5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SDF4Q9BRK5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SDF4Q9BRK5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SDF4Q9BRK5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SDF4Q9BRK5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SDF4Q9BRK5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SDF4Q9BRK5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SDF4Q9BRK5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SDF4Q9BRK5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SDF4Q9BRK5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SDF4Q9BRK5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SDF4Q9BRK5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SDF4Q9BRK5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SDF4Q9BRK5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SDF4Q9BRK5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SDF4Q9BRK5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SDF4Q9BRK5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SDF4Q9BRK5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SDF4Q9BRK5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SDF4Q9BRK5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SDF4Q9BRK5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SDF4Q9BRK5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
SDF4Q9BRK5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SDF4Q9BRK5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SDF4Q9BRK5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SDF4Q9BRK5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SDF4Q9BRK5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SDF4Q9BRK5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SDF4Q9BRK5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SDF4Q9BRK5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SDF4Q9BRK5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
SDF4Q9BRK5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SDF4Q9BRK5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SDF4Q9BRK5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SDF4Q9BRK5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SDF4Q9BRK5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SDF4Q9BRK5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SDF4Q9BRK5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SDF4Q9BRK5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SDF4Q9BRK5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
SDF4Q9BRK5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SDF4Q9BRK5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SDF4Q9BRK5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SDF4Q9BRK5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SDF4Q9BRK5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SDF4Q9BRK5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SDF4Q9BRK5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SDF4Q9BRK5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SDF4Q9BRK5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
SDF4Q9BRK5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
SDF4Q9BRK5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SDF4Q9BRK5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SDF4Q9BRK5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SDF4Q9BRK5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SDF4Q9BRK5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SDF4Q9BRK5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SDF4Q9BRK5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SDF4Q9BRK5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SDF4Q9BRK5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SDF4Q9BRK5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SDF4Q9BRK5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SDF4Q9BRK5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
SDF4Q9BRK5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SDF4Q9BRK5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
SDF4Q9BRK5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SDF4Q9BRK5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SDF4Q9BRK5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms