Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR11

ZSWIM1, Zinc finger SWIM domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZSWIM1Q9BR11 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZSWIM1Q9BR11 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZSWIM1Q9BR11 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZSWIM1Q9BR11 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZSWIM1Q9BR11 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZSWIM1Q9BR11 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZSWIM1Q9BR11 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZSWIM1Q9BR11 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZSWIM1Q9BR11 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZSWIM1Q9BR11 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZSWIM1Q9BR11 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZSWIM1Q9BR11 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZSWIM1Q9BR11 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ZSWIM1Q9BR11 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ZSWIM1Q9BR11 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ZSWIM1Q9BR11 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZSWIM1Q9BR11 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZSWIM1Q9BR11 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZSWIM1Q9BR11 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZSWIM1Q9BR11 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZSWIM1Q9BR11 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZSWIM1Q9BR11 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZSWIM1Q9BR11 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZSWIM1Q9BR11 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZSWIM1Q9BR11 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZSWIM1Q9BR11 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZSWIM1Q9BR11 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZSWIM1Q9BR11 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZSWIM1Q9BR11 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZSWIM1Q9BR11 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZSWIM1Q9BR11 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZSWIM1Q9BR11 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZSWIM1Q9BR11 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZSWIM1Q9BR11 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZSWIM1Q9BR11 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZSWIM1Q9BR11 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZSWIM1Q9BR11 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
ZSWIM1Q9BR11 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZSWIM1Q9BR11 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZSWIM1Q9BR11 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ZSWIM1Q9BR11 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZSWIM1Q9BR11 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZSWIM1Q9BR11 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZSWIM1Q9BR11 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZSWIM1Q9BR11 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZSWIM1Q9BR11 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZSWIM1Q9BR11 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZSWIM1Q9BR11 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZSWIM1Q9BR11 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
ZSWIM1Q9BR11 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZSWIM1Q9BR11 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZSWIM1Q9BR11 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZSWIM1Q9BR11 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZSWIM1Q9BR11 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
ZSWIM1Q9BR11 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZSWIM1Q9BR11 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZSWIM1Q9BR11 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZSWIM1Q9BR11 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
ZSWIM1Q9BR11 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
ZSWIM1Q9BR11 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
ZSWIM1Q9BR11 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZSWIM1Q9BR11 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZSWIM1Q9BR11 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
ZSWIM1Q9BR11 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZSWIM1Q9BR11 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZSWIM1Q9BR11 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZSWIM1Q9BR11 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZSWIM1Q9BR11 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZSWIM1Q9BR11 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZSWIM1Q9BR11 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZSWIM1Q9BR11 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZSWIM1Q9BR11 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZSWIM1Q9BR11 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZSWIM1Q9BR11 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZSWIM1Q9BR11 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZSWIM1Q9BR11 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZSWIM1Q9BR11 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZSWIM1Q9BR11 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ZSWIM1Q9BR11 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZSWIM1Q9BR11 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZSWIM1Q9BR11 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ZSWIM1Q9BR11 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZSWIM1Q9BR11 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZSWIM1Q9BR11 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZSWIM1Q9BR11 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZSWIM1Q9BR11 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZSWIM1Q9BR11 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZSWIM1Q9BR11 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZSWIM1Q9BR11 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZSWIM1Q9BR11 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZSWIM1Q9BR11 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZSWIM1Q9BR11 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZSWIM1Q9BR11 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZSWIM1Q9BR11 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZSWIM1Q9BR11 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ZSWIM1Q9BR11 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZSWIM1Q9BR11 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZSWIM1Q9BR11 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZSWIM1Q9BR11 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZSWIM1Q9BR11 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms