Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ70

TCF25, Transcription factor 25, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF25Q9BQ70 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TCF25Q9BQ70 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TCF25Q9BQ70 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TCF25Q9BQ70 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TCF25Q9BQ70 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TCF25Q9BQ70 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TCF25Q9BQ70 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TCF25Q9BQ70 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TCF25Q9BQ70 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TCF25Q9BQ70 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TCF25Q9BQ70 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TCF25Q9BQ70 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TCF25Q9BQ70 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TCF25Q9BQ70 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TCF25Q9BQ70 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TCF25Q9BQ70 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TCF25Q9BQ70 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TCF25Q9BQ70 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TCF25Q9BQ70 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TCF25Q9BQ70 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TCF25Q9BQ70 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TCF25Q9BQ70 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
TCF25Q9BQ70 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TCF25Q9BQ70 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TCF25Q9BQ70 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TCF25Q9BQ70 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TCF25Q9BQ70 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TCF25Q9BQ70 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TCF25Q9BQ70 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TCF25Q9BQ70 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TCF25Q9BQ70 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TCF25Q9BQ70 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TCF25Q9BQ70 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TCF25Q9BQ70 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TCF25Q9BQ70 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TCF25Q9BQ70 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TCF25Q9BQ70 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
TCF25Q9BQ70 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TCF25Q9BQ70 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TCF25Q9BQ70 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TCF25Q9BQ70 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TCF25Q9BQ70 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TCF25Q9BQ70 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TCF25Q9BQ70 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TCF25Q9BQ70 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TCF25Q9BQ70 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TCF25Q9BQ70 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TCF25Q9BQ70 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TCF25Q9BQ70 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TCF25Q9BQ70 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TCF25Q9BQ70 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TCF25Q9BQ70 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TCF25Q9BQ70 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TCF25Q9BQ70 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TCF25Q9BQ70 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TCF25Q9BQ70 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TCF25Q9BQ70 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TCF25Q9BQ70 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TCF25Q9BQ70 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TCF25Q9BQ70 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TCF25Q9BQ70 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TCF25Q9BQ70 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TCF25Q9BQ70 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TCF25Q9BQ70 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TCF25Q9BQ70 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TCF25Q9BQ70 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TCF25Q9BQ70 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TCF25Q9BQ70 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TCF25Q9BQ70 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TCF25Q9BQ70 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TCF25Q9BQ70 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TCF25Q9BQ70 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TCF25Q9BQ70 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TCF25Q9BQ70 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TCF25Q9BQ70 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TCF25Q9BQ70 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
TCF25Q9BQ70 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TCF25Q9BQ70 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TCF25Q9BQ70 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TCF25Q9BQ70 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TCF25Q9BQ70 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TCF25Q9BQ70 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TCF25Q9BQ70 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TCF25Q9BQ70 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TCF25Q9BQ70 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TCF25Q9BQ70 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TCF25Q9BQ70 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TCF25Q9BQ70 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TCF25Q9BQ70 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TCF25Q9BQ70 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TCF25Q9BQ70 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TCF25Q9BQ70 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TCF25Q9BQ70 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TCF25Q9BQ70 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TCF25Q9BQ70 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TCF25Q9BQ70 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TCF25Q9BQ70 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TCF25Q9BQ70 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TCF25Q9BQ70 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TCF25Q9BQ70 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms