Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TREX2Q9BQ50 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TREX2Q9BQ50 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TREX2Q9BQ50 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TREX2Q9BQ50 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TREX2Q9BQ50 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TREX2Q9BQ50 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TREX2Q9BQ50 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TREX2Q9BQ50 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TREX2Q9BQ50 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TREX2Q9BQ50 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TREX2Q9BQ50 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TREX2Q9BQ50 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TREX2Q9BQ50 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TREX2Q9BQ50 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TREX2Q9BQ50 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TREX2Q9BQ50 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TREX2Q9BQ50 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TREX2Q9BQ50 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TREX2Q9BQ50 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TREX2Q9BQ50 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TREX2Q9BQ50 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TREX2Q9BQ50 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TREX2Q9BQ50 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TREX2Q9BQ50 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TREX2Q9BQ50 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TREX2Q9BQ50 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TREX2Q9BQ50 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TREX2Q9BQ50 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TREX2Q9BQ50 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TREX2Q9BQ50 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TREX2Q9BQ50 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TREX2Q9BQ50 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TREX2Q9BQ50 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TREX2Q9BQ50 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TREX2Q9BQ50 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TREX2Q9BQ50 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TREX2Q9BQ50 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TREX2Q9BQ50 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TREX2Q9BQ50 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TREX2Q9BQ50 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TREX2Q9BQ50 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TREX2Q9BQ50 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TREX2Q9BQ50 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TREX2Q9BQ50 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TREX2Q9BQ50 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TREX2Q9BQ50 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TREX2Q9BQ50 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TREX2Q9BQ50 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TREX2Q9BQ50 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TREX2Q9BQ50 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TREX2Q9BQ50 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TREX2Q9BQ50 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TREX2Q9BQ50 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TREX2Q9BQ50 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TREX2Q9BQ50 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TREX2Q9BQ50 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TREX2Q9BQ50 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TREX2Q9BQ50 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TREX2Q9BQ50 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TREX2Q9BQ50 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TREX2Q9BQ50 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TREX2Q9BQ50 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TREX2Q9BQ50 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TREX2Q9BQ50 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TREX2Q9BQ50 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TREX2Q9BQ50 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TREX2Q9BQ50 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TREX2Q9BQ50 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TREX2Q9BQ50 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TREX2Q9BQ50 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TREX2Q9BQ50 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TREX2Q9BQ50 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TREX2Q9BQ50 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TREX2Q9BQ50 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TREX2Q9BQ50 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TREX2Q9BQ50 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TREX2Q9BQ50 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TREX2Q9BQ50 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TREX2Q9BQ50 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TREX2Q9BQ50 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TREX2Q9BQ50 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TREX2Q9BQ50 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TREX2Q9BQ50 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TREX2Q9BQ50 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TREX2Q9BQ50 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TREX2Q9BQ50 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TREX2Q9BQ50 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TREX2Q9BQ50 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TREX2Q9BQ50 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TREX2Q9BQ50 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TREX2Q9BQ50 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TREX2Q9BQ50 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TREX2Q9BQ50 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TREX2Q9BQ50 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TREX2Q9BQ50 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TREX2Q9BQ50 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TREX2Q9BQ50 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TREX2Q9BQ50 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TREX2Q9BQ50 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.5 ms