Protein–RNA interactions for Protein: Q99698

LYST, Lysosomal-trafficking regulator, humanhuman

Predictions only

Length 3,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYSTQ99698 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LYSTQ99698 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LYSTQ99698 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
LYSTQ99698 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LYSTQ99698 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LYSTQ99698 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LYSTQ99698 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LYSTQ99698 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LYSTQ99698 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LYSTQ99698 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LYSTQ99698 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LYSTQ99698 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LYSTQ99698 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
LYSTQ99698 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
LYSTQ99698 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LYSTQ99698 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LYSTQ99698 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LYSTQ99698 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LYSTQ99698 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
LYSTQ99698 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LYSTQ99698 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LYSTQ99698 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
LYSTQ99698 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LYSTQ99698 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LYSTQ99698 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LYSTQ99698 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LYSTQ99698 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LYSTQ99698 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LYSTQ99698 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LYSTQ99698 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LYSTQ99698 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LYSTQ99698 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LYSTQ99698 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LYSTQ99698 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LYSTQ99698 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LYSTQ99698 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LYSTQ99698 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LYSTQ99698 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LYSTQ99698 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LYSTQ99698 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LYSTQ99698 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LYSTQ99698 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
LYSTQ99698 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
LYSTQ99698 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LYSTQ99698 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LYSTQ99698 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LYSTQ99698 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LYSTQ99698 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LYSTQ99698 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LYSTQ99698 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LYSTQ99698 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LYSTQ99698 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LYSTQ99698 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LYSTQ99698 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LYSTQ99698 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LYSTQ99698 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LYSTQ99698 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LYSTQ99698 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LYSTQ99698 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LYSTQ99698 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LYSTQ99698 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LYSTQ99698 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LYSTQ99698 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LYSTQ99698 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LYSTQ99698 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LYSTQ99698 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LYSTQ99698 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LYSTQ99698 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LYSTQ99698 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LYSTQ99698 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LYSTQ99698 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
LYSTQ99698 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LYSTQ99698 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LYSTQ99698 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LYSTQ99698 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LYSTQ99698 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LYSTQ99698 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LYSTQ99698 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LYSTQ99698 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LYSTQ99698 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
LYSTQ99698 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LYSTQ99698 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LYSTQ99698 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LYSTQ99698 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LYSTQ99698 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LYSTQ99698 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LYSTQ99698 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LYSTQ99698 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LYSTQ99698 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LYSTQ99698 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LYSTQ99698 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LYSTQ99698 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LYSTQ99698 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LYSTQ99698 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LYSTQ99698 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LYSTQ99698 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LYSTQ99698 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LYSTQ99698 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LYSTQ99698 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LYSTQ99698 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms