Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PITX2Q99697 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PITX2Q99697 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PITX2Q99697 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PITX2Q99697 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PITX2Q99697 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PITX2Q99697 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PITX2Q99697 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PITX2Q99697 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PITX2Q99697 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PITX2Q99697 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PITX2Q99697 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PITX2Q99697 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PITX2Q99697 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PITX2Q99697 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PITX2Q99697 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PITX2Q99697 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PITX2Q99697 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PITX2Q99697 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PITX2Q99697 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PITX2Q99697 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PITX2Q99697 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PITX2Q99697 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PITX2Q99697 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PITX2Q99697 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PITX2Q99697 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PITX2Q99697 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PITX2Q99697 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PITX2Q99697 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PITX2Q99697 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PITX2Q99697 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PITX2Q99697 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PITX2Q99697 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PITX2Q99697 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PITX2Q99697 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PITX2Q99697 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PITX2Q99697 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PITX2Q99697 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PITX2Q99697 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PITX2Q99697 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PITX2Q99697 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PITX2Q99697 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PITX2Q99697 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PITX2Q99697 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PITX2Q99697 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PITX2Q99697 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PITX2Q99697 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PITX2Q99697 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PITX2Q99697 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PITX2Q99697 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PITX2Q99697 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PITX2Q99697 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PITX2Q99697 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PITX2Q99697 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PITX2Q99697 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PITX2Q99697 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PITX2Q99697 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PITX2Q99697 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PITX2Q99697 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PITX2Q99697 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PITX2Q99697 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PITX2Q99697 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PITX2Q99697 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PITX2Q99697 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PITX2Q99697 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PITX2Q99697 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PITX2Q99697 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PITX2Q99697 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PITX2Q99697 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PITX2Q99697 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PITX2Q99697 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PITX2Q99697 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PITX2Q99697 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PITX2Q99697 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PITX2Q99697 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PITX2Q99697 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PITX2Q99697 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PITX2Q99697 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PITX2Q99697 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PITX2Q99697 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PITX2Q99697 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PITX2Q99697 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PITX2Q99697 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PITX2Q99697 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PITX2Q99697 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PITX2Q99697 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PITX2Q99697 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PITX2Q99697 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PITX2Q99697 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PITX2Q99697 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PITX2Q99697 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PITX2Q99697 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PITX2Q99697 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PITX2Q99697 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PITX2Q99697 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PITX2Q99697 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PITX2Q99697 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PITX2Q99697 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PITX2Q99697 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PITX2Q99697 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms