Protein–RNA interactions for Protein: Q99523

SORT1, Sortilin, humanhuman

Predictions only

Length 831 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORT1Q99523 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SORT1Q99523 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SORT1Q99523 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SORT1Q99523 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SORT1Q99523 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SORT1Q99523 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SORT1Q99523 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SORT1Q99523 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SORT1Q99523 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SORT1Q99523 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SORT1Q99523 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SORT1Q99523 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SORT1Q99523 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SORT1Q99523 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SORT1Q99523 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SORT1Q99523 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SORT1Q99523 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SORT1Q99523 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SORT1Q99523 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SORT1Q99523 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SORT1Q99523 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SORT1Q99523 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SORT1Q99523 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SORT1Q99523 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SORT1Q99523 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SORT1Q99523 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SORT1Q99523 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SORT1Q99523 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SORT1Q99523 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SORT1Q99523 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SORT1Q99523 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SORT1Q99523 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SORT1Q99523 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SORT1Q99523 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
SORT1Q99523 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SORT1Q99523 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SORT1Q99523 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SORT1Q99523 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SORT1Q99523 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SORT1Q99523 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SORT1Q99523 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SORT1Q99523 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SORT1Q99523 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SORT1Q99523 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SORT1Q99523 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SORT1Q99523 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SORT1Q99523 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SORT1Q99523 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SORT1Q99523 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SORT1Q99523 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SORT1Q99523 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SORT1Q99523 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SORT1Q99523 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SORT1Q99523 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SORT1Q99523 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SORT1Q99523 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SORT1Q99523 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SORT1Q99523 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SORT1Q99523 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SORT1Q99523 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SORT1Q99523 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SORT1Q99523 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SORT1Q99523 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SORT1Q99523 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SORT1Q99523 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SORT1Q99523 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SORT1Q99523 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SORT1Q99523 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SORT1Q99523 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SORT1Q99523 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SORT1Q99523 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SORT1Q99523 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SORT1Q99523 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SORT1Q99523 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SORT1Q99523 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SORT1Q99523 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SORT1Q99523 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SORT1Q99523 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SORT1Q99523 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SORT1Q99523 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SORT1Q99523 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SORT1Q99523 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SORT1Q99523 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SORT1Q99523 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SORT1Q99523 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SORT1Q99523 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SORT1Q99523 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SORT1Q99523 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SORT1Q99523 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SORT1Q99523 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SORT1Q99523 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SORT1Q99523 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SORT1Q99523 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SORT1Q99523 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SORT1Q99523 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SORT1Q99523 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SORT1Q99523 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SORT1Q99523 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SORT1Q99523 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SORT1Q99523 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms