Protein–RNA interactions for Protein: Q99466

NOTCH4, Neurogenic locus notch homolog protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 2,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTCH4Q99466 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NOTCH4Q99466 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NOTCH4Q99466 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NOTCH4Q99466 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NOTCH4Q99466 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NOTCH4Q99466 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NOTCH4Q99466 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NOTCH4Q99466 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NOTCH4Q99466 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NOTCH4Q99466 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NOTCH4Q99466 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NOTCH4Q99466 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NOTCH4Q99466 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NOTCH4Q99466 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NOTCH4Q99466 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NOTCH4Q99466 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NOTCH4Q99466 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NOTCH4Q99466 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NOTCH4Q99466 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NOTCH4Q99466 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NOTCH4Q99466 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NOTCH4Q99466 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NOTCH4Q99466 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NOTCH4Q99466 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NOTCH4Q99466 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NOTCH4Q99466 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NOTCH4Q99466 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NOTCH4Q99466 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NOTCH4Q99466 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NOTCH4Q99466 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NOTCH4Q99466 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NOTCH4Q99466 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NOTCH4Q99466 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NOTCH4Q99466 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NOTCH4Q99466 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NOTCH4Q99466 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NOTCH4Q99466 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NOTCH4Q99466 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NOTCH4Q99466 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NOTCH4Q99466 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NOTCH4Q99466 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NOTCH4Q99466 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NOTCH4Q99466 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NOTCH4Q99466 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NOTCH4Q99466 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NOTCH4Q99466 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NOTCH4Q99466 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NOTCH4Q99466 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NOTCH4Q99466 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NOTCH4Q99466 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NOTCH4Q99466 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NOTCH4Q99466 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NOTCH4Q99466 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NOTCH4Q99466 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NOTCH4Q99466 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NOTCH4Q99466 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NOTCH4Q99466 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NOTCH4Q99466 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NOTCH4Q99466 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NOTCH4Q99466 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NOTCH4Q99466 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NOTCH4Q99466 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NOTCH4Q99466 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NOTCH4Q99466 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NOTCH4Q99466 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NOTCH4Q99466 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NOTCH4Q99466 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NOTCH4Q99466 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NOTCH4Q99466 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NOTCH4Q99466 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NOTCH4Q99466 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NOTCH4Q99466 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NOTCH4Q99466 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NOTCH4Q99466 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NOTCH4Q99466 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NOTCH4Q99466 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NOTCH4Q99466 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NOTCH4Q99466 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NOTCH4Q99466 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NOTCH4Q99466 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NOTCH4Q99466 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NOTCH4Q99466 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NOTCH4Q99466 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NOTCH4Q99466 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NOTCH4Q99466 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NOTCH4Q99466 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NOTCH4Q99466 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NOTCH4Q99466 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NOTCH4Q99466 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NOTCH4Q99466 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NOTCH4Q99466 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NOTCH4Q99466 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NOTCH4Q99466 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NOTCH4Q99466 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NOTCH4Q99466 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NOTCH4Q99466 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NOTCH4Q99466 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NOTCH4Q99466 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NOTCH4Q99466 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NOTCH4Q99466 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms