Protein–RNA interactions for Protein: Q96T23

RSF1, Remodeling and spacing factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSF1Q96T23 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC43.94■■■■■ 4.62
RSF1Q96T23 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC43.94■■■■■ 4.62
RSF1Q96T23 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.94■■■■■ 4.62
RSF1Q96T23 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.94■■■■■ 4.62
RSF1Q96T23 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC43.94■■■■■ 4.62
RSF1Q96T23 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC43.93■■■■■ 4.62
RSF1Q96T23 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC43.93■■■■■ 4.62
RSF1Q96T23 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC43.92■■■■■ 4.62
RSF1Q96T23 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC43.92■■■■■ 4.62
RSF1Q96T23 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.92■■■■■ 4.62
RSF1Q96T23 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC43.92■■■■■ 4.62
RSF1Q96T23 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC43.91■■■■■ 4.62
RSF1Q96T23 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC43.9■■■■■ 4.62
RSF1Q96T23 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.9■■■■■ 4.62
RSF1Q96T23 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC43.9■■■■■ 4.62
RSF1Q96T23 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.9■■■■■ 4.62
RSF1Q96T23 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.89■■■■■ 4.62
RSF1Q96T23 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC43.89■■■■■ 4.62
RSF1Q96T23 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.89■■■■■ 4.62
RSF1Q96T23 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.89■■■■■ 4.62
RSF1Q96T23 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.89■■■■■ 4.62
RSF1Q96T23 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.89■■■■■ 4.62
RSF1Q96T23 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC43.89■■■■■ 4.62
RSF1Q96T23 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.89■■■■■ 4.62
RSF1Q96T23 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC43.87■■■■■ 4.61
RSF1Q96T23 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC43.87■■■■■ 4.61
RSF1Q96T23 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.87■■■■■ 4.61
RSF1Q96T23 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.86■■■■■ 4.61
RSF1Q96T23 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC43.86■■■■■ 4.61
RSF1Q96T23 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.86■■■■■ 4.61
RSF1Q96T23 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.86■■■■■ 4.61
RSF1Q96T23 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC43.86■■■■■ 4.61
RSF1Q96T23 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.85■■■■■ 4.61
RSF1Q96T23 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.84■■■■■ 4.61
RSF1Q96T23 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.84■■■■■ 4.61
RSF1Q96T23 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.84■■■■■ 4.61
RSF1Q96T23 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC43.83■■■■■ 4.61
RSF1Q96T23 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.83■■■■■ 4.61
RSF1Q96T23 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.83■■■■■ 4.61
RSF1Q96T23 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC43.82■■■■■ 4.61
RSF1Q96T23 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.82■■■■■ 4.61
RSF1Q96T23 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.82■■■■■ 4.61
RSF1Q96T23 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC43.82■■■■■ 4.61
RSF1Q96T23 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.82■■■■■ 4.6
RSF1Q96T23 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC43.82■■■■■ 4.6
RSF1Q96T23 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.81■■■■■ 4.6
RSF1Q96T23 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC43.81■■■■■ 4.6
RSF1Q96T23 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC43.81■■■■■ 4.6
RSF1Q96T23 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.8■■■■■ 4.6
RSF1Q96T23 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC43.8■■■■■ 4.6
RSF1Q96T23 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC43.8■■■■■ 4.6
RSF1Q96T23 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC43.79■■■■■ 4.6
RSF1Q96T23 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC43.79■■■■■ 4.6
RSF1Q96T23 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.79■■■■■ 4.6
RSF1Q96T23 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC43.79■■■■■ 4.6
RSF1Q96T23 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC43.78■■■■■ 4.6
RSF1Q96T23 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.78■■■■■ 4.6
RSF1Q96T23 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.76■■■■■ 4.6
RSF1Q96T23 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC43.76■■■■■ 4.6
RSF1Q96T23 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.76■■■■■ 4.6
RSF1Q96T23 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC43.76■■■■■ 4.6
RSF1Q96T23 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC43.76■■■■■ 4.6
RSF1Q96T23 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.75■■■■■ 4.59
RSF1Q96T23 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.75■■■■■ 4.59
RSF1Q96T23 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.74■■■■■ 4.59
RSF1Q96T23 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC43.74■■■■■ 4.59
RSF1Q96T23 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.74■■■■■ 4.59
RSF1Q96T23 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.74■■■■■ 4.59
RSF1Q96T23 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC43.74■■■■■ 4.59
RSF1Q96T23 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.73■■■■■ 4.59
RSF1Q96T23 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC43.73■■■■■ 4.59
RSF1Q96T23 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.73■■■■■ 4.59
RSF1Q96T23 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.72■■■■■ 4.59
RSF1Q96T23 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC43.72■■■■■ 4.59
RSF1Q96T23 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.72■■■■■ 4.59
RSF1Q96T23 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC43.71■■■■■ 4.59
RSF1Q96T23 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.71■■■■■ 4.59
RSF1Q96T23 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC43.71■■■■■ 4.59
RSF1Q96T23 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.71■■■■■ 4.59
RSF1Q96T23 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC43.71■■■■■ 4.59
RSF1Q96T23 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.7■■■■■ 4.59
RSF1Q96T23 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43.7■■■■■ 4.59
RSF1Q96T23 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC43.7■■■■■ 4.59
RSF1Q96T23 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC43.69■■■■■ 4.58
RSF1Q96T23 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC43.69■■■■■ 4.58
RSF1Q96T23 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC43.69■■■■■ 4.58
RSF1Q96T23 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC43.68■■■■■ 4.58
RSF1Q96T23 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC43.68■■■■■ 4.58
RSF1Q96T23 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC43.66■■■■■ 4.58
RSF1Q96T23 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.66■■■■■ 4.58
RSF1Q96T23 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC43.66■■■■■ 4.58
RSF1Q96T23 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC43.66■■■■■ 4.58
RSF1Q96T23 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.65■■■■■ 4.58
RSF1Q96T23 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC43.65■■■■■ 4.58
RSF1Q96T23 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC43.65■■■■■ 4.58
RSF1Q96T23 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.65■■■■■ 4.58
RSF1Q96T23 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC43.64■■■■■ 4.58
RSF1Q96T23 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.64■■■■■ 4.58
RSF1Q96T23 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC43.64■■■■■ 4.58
RSF1Q96T23 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC43.64■■■■■ 4.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 417.9 ms