Protein–RNA interactions for Protein: Q96SM3

CPXM1, Probable carboxypeptidase X1, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPXM1Q96SM3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CPXM1Q96SM3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CPXM1Q96SM3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CPXM1Q96SM3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CPXM1Q96SM3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CPXM1Q96SM3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CPXM1Q96SM3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CPXM1Q96SM3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CPXM1Q96SM3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CPXM1Q96SM3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CPXM1Q96SM3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CPXM1Q96SM3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CPXM1Q96SM3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CPXM1Q96SM3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CPXM1Q96SM3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CPXM1Q96SM3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CPXM1Q96SM3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CPXM1Q96SM3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CPXM1Q96SM3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CPXM1Q96SM3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CPXM1Q96SM3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CPXM1Q96SM3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CPXM1Q96SM3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CPXM1Q96SM3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CPXM1Q96SM3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CPXM1Q96SM3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CPXM1Q96SM3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CPXM1Q96SM3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CPXM1Q96SM3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CPXM1Q96SM3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CPXM1Q96SM3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CPXM1Q96SM3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CPXM1Q96SM3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CPXM1Q96SM3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CPXM1Q96SM3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CPXM1Q96SM3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CPXM1Q96SM3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CPXM1Q96SM3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CPXM1Q96SM3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CPXM1Q96SM3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CPXM1Q96SM3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CPXM1Q96SM3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CPXM1Q96SM3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CPXM1Q96SM3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CPXM1Q96SM3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CPXM1Q96SM3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CPXM1Q96SM3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CPXM1Q96SM3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CPXM1Q96SM3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CPXM1Q96SM3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CPXM1Q96SM3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CPXM1Q96SM3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CPXM1Q96SM3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CPXM1Q96SM3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CPXM1Q96SM3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CPXM1Q96SM3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CPXM1Q96SM3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CPXM1Q96SM3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CPXM1Q96SM3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CPXM1Q96SM3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CPXM1Q96SM3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CPXM1Q96SM3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CPXM1Q96SM3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CPXM1Q96SM3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CPXM1Q96SM3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CPXM1Q96SM3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CPXM1Q96SM3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CPXM1Q96SM3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CPXM1Q96SM3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CPXM1Q96SM3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CPXM1Q96SM3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CPXM1Q96SM3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CPXM1Q96SM3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CPXM1Q96SM3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CPXM1Q96SM3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CPXM1Q96SM3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CPXM1Q96SM3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CPXM1Q96SM3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CPXM1Q96SM3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CPXM1Q96SM3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CPXM1Q96SM3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CPXM1Q96SM3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CPXM1Q96SM3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CPXM1Q96SM3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CPXM1Q96SM3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CPXM1Q96SM3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CPXM1Q96SM3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CPXM1Q96SM3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CPXM1Q96SM3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CPXM1Q96SM3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CPXM1Q96SM3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CPXM1Q96SM3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CPXM1Q96SM3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CPXM1Q96SM3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CPXM1Q96SM3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CPXM1Q96SM3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CPXM1Q96SM3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CPXM1Q96SM3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CPXM1Q96SM3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CPXM1Q96SM3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms