Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCNX1Q96RV3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCNX1Q96RV3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PCNX1Q96RV3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCNX1Q96RV3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCNX1Q96RV3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCNX1Q96RV3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PCNX1Q96RV3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCNX1Q96RV3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCNX1Q96RV3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PCNX1Q96RV3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCNX1Q96RV3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PCNX1Q96RV3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCNX1Q96RV3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCNX1Q96RV3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCNX1Q96RV3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCNX1Q96RV3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCNX1Q96RV3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCNX1Q96RV3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCNX1Q96RV3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCNX1Q96RV3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCNX1Q96RV3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCNX1Q96RV3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCNX1Q96RV3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCNX1Q96RV3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCNX1Q96RV3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCNX1Q96RV3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCNX1Q96RV3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
PCNX1Q96RV3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCNX1Q96RV3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCNX1Q96RV3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCNX1Q96RV3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCNX1Q96RV3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCNX1Q96RV3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCNX1Q96RV3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCNX1Q96RV3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCNX1Q96RV3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCNX1Q96RV3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCNX1Q96RV3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCNX1Q96RV3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PCNX1Q96RV3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCNX1Q96RV3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCNX1Q96RV3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCNX1Q96RV3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCNX1Q96RV3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCNX1Q96RV3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PCNX1Q96RV3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCNX1Q96RV3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCNX1Q96RV3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCNX1Q96RV3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCNX1Q96RV3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCNX1Q96RV3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCNX1Q96RV3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCNX1Q96RV3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCNX1Q96RV3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCNX1Q96RV3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCNX1Q96RV3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCNX1Q96RV3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCNX1Q96RV3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCNX1Q96RV3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCNX1Q96RV3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCNX1Q96RV3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCNX1Q96RV3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCNX1Q96RV3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCNX1Q96RV3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCNX1Q96RV3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCNX1Q96RV3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCNX1Q96RV3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCNX1Q96RV3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCNX1Q96RV3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCNX1Q96RV3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCNX1Q96RV3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCNX1Q96RV3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCNX1Q96RV3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PCNX1Q96RV3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PCNX1Q96RV3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PCNX1Q96RV3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCNX1Q96RV3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCNX1Q96RV3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCNX1Q96RV3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCNX1Q96RV3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCNX1Q96RV3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCNX1Q96RV3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCNX1Q96RV3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCNX1Q96RV3 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCNX1Q96RV3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCNX1Q96RV3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCNX1Q96RV3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCNX1Q96RV3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCNX1Q96RV3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCNX1Q96RV3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCNX1Q96RV3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCNX1Q96RV3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCNX1Q96RV3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PCNX1Q96RV3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCNX1Q96RV3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCNX1Q96RV3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCNX1Q96RV3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCNX1Q96RV3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCNX1Q96RV3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
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