Protein–RNA interactions for Protein: Q96RT8

TUBGCP5, Gamma-tubulin complex component 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP5Q96RT8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TUBGCP5Q96RT8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TUBGCP5Q96RT8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TUBGCP5Q96RT8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TUBGCP5Q96RT8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TUBGCP5Q96RT8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TUBGCP5Q96RT8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TUBGCP5Q96RT8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TUBGCP5Q96RT8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TUBGCP5Q96RT8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TUBGCP5Q96RT8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TUBGCP5Q96RT8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TUBGCP5Q96RT8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TUBGCP5Q96RT8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TUBGCP5Q96RT8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TUBGCP5Q96RT8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TUBGCP5Q96RT8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TUBGCP5Q96RT8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TUBGCP5Q96RT8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TUBGCP5Q96RT8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TUBGCP5Q96RT8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TUBGCP5Q96RT8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TUBGCP5Q96RT8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TUBGCP5Q96RT8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TUBGCP5Q96RT8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TUBGCP5Q96RT8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TUBGCP5Q96RT8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TUBGCP5Q96RT8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TUBGCP5Q96RT8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TUBGCP5Q96RT8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TUBGCP5Q96RT8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TUBGCP5Q96RT8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TUBGCP5Q96RT8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBGCP5Q96RT8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBGCP5Q96RT8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBGCP5Q96RT8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBGCP5Q96RT8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBGCP5Q96RT8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBGCP5Q96RT8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBGCP5Q96RT8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBGCP5Q96RT8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBGCP5Q96RT8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBGCP5Q96RT8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBGCP5Q96RT8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBGCP5Q96RT8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBGCP5Q96RT8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBGCP5Q96RT8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBGCP5Q96RT8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBGCP5Q96RT8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBGCP5Q96RT8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBGCP5Q96RT8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TUBGCP5Q96RT8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TUBGCP5Q96RT8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TUBGCP5Q96RT8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TUBGCP5Q96RT8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TUBGCP5Q96RT8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TUBGCP5Q96RT8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TUBGCP5Q96RT8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TUBGCP5Q96RT8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TUBGCP5Q96RT8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TUBGCP5Q96RT8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TUBGCP5Q96RT8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TUBGCP5Q96RT8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TUBGCP5Q96RT8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TUBGCP5Q96RT8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TUBGCP5Q96RT8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TUBGCP5Q96RT8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TUBGCP5Q96RT8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TUBGCP5Q96RT8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TUBGCP5Q96RT8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TUBGCP5Q96RT8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TUBGCP5Q96RT8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TUBGCP5Q96RT8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TUBGCP5Q96RT8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBGCP5Q96RT8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBGCP5Q96RT8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBGCP5Q96RT8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBGCP5Q96RT8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBGCP5Q96RT8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBGCP5Q96RT8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBGCP5Q96RT8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBGCP5Q96RT8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBGCP5Q96RT8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBGCP5Q96RT8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBGCP5Q96RT8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBGCP5Q96RT8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBGCP5Q96RT8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBGCP5Q96RT8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBGCP5Q96RT8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TUBGCP5Q96RT8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TUBGCP5Q96RT8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TUBGCP5Q96RT8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TUBGCP5Q96RT8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TUBGCP5Q96RT8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TUBGCP5Q96RT8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TUBGCP5Q96RT8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TUBGCP5Q96RT8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TUBGCP5Q96RT8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TUBGCP5Q96RT8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TUBGCP5Q96RT8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms