Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE6

ZIM3, Zinc finger imprinted 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIM3Q96PE6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZIM3Q96PE6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZIM3Q96PE6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZIM3Q96PE6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ZIM3Q96PE6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZIM3Q96PE6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZIM3Q96PE6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZIM3Q96PE6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZIM3Q96PE6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZIM3Q96PE6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZIM3Q96PE6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZIM3Q96PE6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZIM3Q96PE6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZIM3Q96PE6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZIM3Q96PE6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZIM3Q96PE6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZIM3Q96PE6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZIM3Q96PE6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ZIM3Q96PE6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZIM3Q96PE6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZIM3Q96PE6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZIM3Q96PE6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZIM3Q96PE6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZIM3Q96PE6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZIM3Q96PE6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZIM3Q96PE6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZIM3Q96PE6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZIM3Q96PE6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZIM3Q96PE6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZIM3Q96PE6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZIM3Q96PE6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZIM3Q96PE6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZIM3Q96PE6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZIM3Q96PE6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZIM3Q96PE6 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ZIM3Q96PE6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZIM3Q96PE6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZIM3Q96PE6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZIM3Q96PE6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZIM3Q96PE6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZIM3Q96PE6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZIM3Q96PE6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZIM3Q96PE6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZIM3Q96PE6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZIM3Q96PE6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ZIM3Q96PE6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZIM3Q96PE6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZIM3Q96PE6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZIM3Q96PE6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZIM3Q96PE6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZIM3Q96PE6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZIM3Q96PE6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZIM3Q96PE6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZIM3Q96PE6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZIM3Q96PE6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ZIM3Q96PE6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZIM3Q96PE6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZIM3Q96PE6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZIM3Q96PE6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZIM3Q96PE6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZIM3Q96PE6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZIM3Q96PE6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZIM3Q96PE6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZIM3Q96PE6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZIM3Q96PE6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZIM3Q96PE6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZIM3Q96PE6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZIM3Q96PE6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZIM3Q96PE6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZIM3Q96PE6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZIM3Q96PE6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZIM3Q96PE6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ZIM3Q96PE6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ZIM3Q96PE6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZIM3Q96PE6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZIM3Q96PE6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZIM3Q96PE6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZIM3Q96PE6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZIM3Q96PE6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZIM3Q96PE6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZIM3Q96PE6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZIM3Q96PE6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZIM3Q96PE6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZIM3Q96PE6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZIM3Q96PE6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZIM3Q96PE6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZIM3Q96PE6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZIM3Q96PE6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZIM3Q96PE6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZIM3Q96PE6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZIM3Q96PE6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZIM3Q96PE6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZIM3Q96PE6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZIM3Q96PE6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZIM3Q96PE6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZIM3Q96PE6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZIM3Q96PE6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZIM3Q96PE6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZIM3Q96PE6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZIM3Q96PE6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms