Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
NLRP3Q96P20 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
NLRP3Q96P20 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
NLRP3Q96P20 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
NLRP3Q96P20 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
NLRP3Q96P20 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
NLRP3Q96P20 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
NLRP3Q96P20 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
NLRP3Q96P20 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
NLRP3Q96P20 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC30.31■■■□□ 2.44
NLRP3Q96P20 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
NLRP3Q96P20 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
NLRP3Q96P20 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
NLRP3Q96P20 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
NLRP3Q96P20 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
NLRP3Q96P20 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC30.3■■■□□ 2.44
NLRP3Q96P20 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
NLRP3Q96P20 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
NLRP3Q96P20 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
NLRP3Q96P20 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
NLRP3Q96P20 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
NLRP3Q96P20 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
NLRP3Q96P20 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
NLRP3Q96P20 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
NLRP3Q96P20 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
NLRP3Q96P20 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
NLRP3Q96P20 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
NLRP3Q96P20 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
NLRP3Q96P20 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
NLRP3Q96P20 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
NLRP3Q96P20 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
NLRP3Q96P20 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
NLRP3Q96P20 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
NLRP3Q96P20 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
NLRP3Q96P20 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
NLRP3Q96P20 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
NLRP3Q96P20 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
NLRP3Q96P20 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
NLRP3Q96P20 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
NLRP3Q96P20 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
NLRP3Q96P20 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
NLRP3Q96P20 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
NLRP3Q96P20 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
NLRP3Q96P20 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
NLRP3Q96P20 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
NLRP3Q96P20 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
NLRP3Q96P20 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
NLRP3Q96P20 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
NLRP3Q96P20 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
NLRP3Q96P20 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
NLRP3Q96P20 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
NLRP3Q96P20 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
NLRP3Q96P20 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
NLRP3Q96P20 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
NLRP3Q96P20 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
NLRP3Q96P20 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
NLRP3Q96P20 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
NLRP3Q96P20 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
NLRP3Q96P20 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
NLRP3Q96P20 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
NLRP3Q96P20 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
NLRP3Q96P20 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
NLRP3Q96P20 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
NLRP3Q96P20 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
NLRP3Q96P20 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
NLRP3Q96P20 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
NLRP3Q96P20 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
NLRP3Q96P20 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
NLRP3Q96P20 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
NLRP3Q96P20 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
NLRP3Q96P20 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC30.2■■■□□ 2.42
NLRP3Q96P20 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
NLRP3Q96P20 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NLRP3Q96P20 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
NLRP3Q96P20 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC30.19■■■□□ 2.42
NLRP3Q96P20 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NLRP3Q96P20 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
NLRP3Q96P20 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
NLRP3Q96P20 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
NLRP3Q96P20 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
NLRP3Q96P20 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
NLRP3Q96P20 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NLRP3Q96P20 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NLRP3Q96P20 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
NLRP3Q96P20 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NLRP3Q96P20 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
NLRP3Q96P20 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
NLRP3Q96P20 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
NLRP3Q96P20 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
NLRP3Q96P20 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
NLRP3Q96P20 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NLRP3Q96P20 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
NLRP3Q96P20 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NLRP3Q96P20 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
NLRP3Q96P20 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
NLRP3Q96P20 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
NLRP3Q96P20 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
NLRP3Q96P20 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
NLRP3Q96P20 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
NLRP3Q96P20 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms