Protein–RNA interactions for Protein: Q96NR8

RDH12, Retinol dehydrogenase 12, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH12Q96NR8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RDH12Q96NR8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RDH12Q96NR8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RDH12Q96NR8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RDH12Q96NR8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RDH12Q96NR8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RDH12Q96NR8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RDH12Q96NR8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RDH12Q96NR8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RDH12Q96NR8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RDH12Q96NR8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RDH12Q96NR8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RDH12Q96NR8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RDH12Q96NR8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RDH12Q96NR8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RDH12Q96NR8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RDH12Q96NR8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RDH12Q96NR8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RDH12Q96NR8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RDH12Q96NR8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RDH12Q96NR8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RDH12Q96NR8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RDH12Q96NR8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RDH12Q96NR8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RDH12Q96NR8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RDH12Q96NR8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RDH12Q96NR8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RDH12Q96NR8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RDH12Q96NR8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RDH12Q96NR8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
RDH12Q96NR8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RDH12Q96NR8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RDH12Q96NR8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RDH12Q96NR8 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RDH12Q96NR8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RDH12Q96NR8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RDH12Q96NR8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RDH12Q96NR8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RDH12Q96NR8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RDH12Q96NR8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RDH12Q96NR8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RDH12Q96NR8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RDH12Q96NR8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RDH12Q96NR8 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RDH12Q96NR8 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RDH12Q96NR8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RDH12Q96NR8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RDH12Q96NR8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RDH12Q96NR8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RDH12Q96NR8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RDH12Q96NR8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RDH12Q96NR8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RDH12Q96NR8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RDH12Q96NR8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RDH12Q96NR8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RDH12Q96NR8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RDH12Q96NR8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RDH12Q96NR8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RDH12Q96NR8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RDH12Q96NR8 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RDH12Q96NR8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RDH12Q96NR8 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RDH12Q96NR8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RDH12Q96NR8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RDH12Q96NR8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RDH12Q96NR8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RDH12Q96NR8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RDH12Q96NR8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RDH12Q96NR8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RDH12Q96NR8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RDH12Q96NR8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RDH12Q96NR8 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RDH12Q96NR8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RDH12Q96NR8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RDH12Q96NR8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RDH12Q96NR8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RDH12Q96NR8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RDH12Q96NR8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RDH12Q96NR8 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RDH12Q96NR8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RDH12Q96NR8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RDH12Q96NR8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RDH12Q96NR8 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RDH12Q96NR8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RDH12Q96NR8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RDH12Q96NR8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RDH12Q96NR8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RDH12Q96NR8 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RDH12Q96NR8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RDH12Q96NR8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RDH12Q96NR8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RDH12Q96NR8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RDH12Q96NR8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RDH12Q96NR8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RDH12Q96NR8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RDH12Q96NR8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RDH12Q96NR8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RDH12Q96NR8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RDH12Q96NR8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RDH12Q96NR8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms