Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
C9orf85Q96MD7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
C9orf85Q96MD7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C9orf85Q96MD7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C9orf85Q96MD7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C9orf85Q96MD7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C9orf85Q96MD7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C9orf85Q96MD7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C9orf85Q96MD7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C9orf85Q96MD7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C9orf85Q96MD7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C9orf85Q96MD7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C9orf85Q96MD7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C9orf85Q96MD7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C9orf85Q96MD7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C9orf85Q96MD7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C9orf85Q96MD7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C9orf85Q96MD7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C9orf85Q96MD7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C9orf85Q96MD7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C9orf85Q96MD7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C9orf85Q96MD7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C9orf85Q96MD7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C9orf85Q96MD7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C9orf85Q96MD7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C9orf85Q96MD7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
C9orf85Q96MD7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C9orf85Q96MD7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
C9orf85Q96MD7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C9orf85Q96MD7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C9orf85Q96MD7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C9orf85Q96MD7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C9orf85Q96MD7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C9orf85Q96MD7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf85Q96MD7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf85Q96MD7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf85Q96MD7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf85Q96MD7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf85Q96MD7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf85Q96MD7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf85Q96MD7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf85Q96MD7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf85Q96MD7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf85Q96MD7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf85Q96MD7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf85Q96MD7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf85Q96MD7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf85Q96MD7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf85Q96MD7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf85Q96MD7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf85Q96MD7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf85Q96MD7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf85Q96MD7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf85Q96MD7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf85Q96MD7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf85Q96MD7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf85Q96MD7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf85Q96MD7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf85Q96MD7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf85Q96MD7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf85Q96MD7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C9orf85Q96MD7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C9orf85Q96MD7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C9orf85Q96MD7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C9orf85Q96MD7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C9orf85Q96MD7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C9orf85Q96MD7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
C9orf85Q96MD7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C9orf85Q96MD7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
C9orf85Q96MD7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C9orf85Q96MD7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
C9orf85Q96MD7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C9orf85Q96MD7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
C9orf85Q96MD7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf85Q96MD7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf85Q96MD7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf85Q96MD7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf85Q96MD7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf85Q96MD7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf85Q96MD7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C9orf85Q96MD7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf85Q96MD7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf85Q96MD7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf85Q96MD7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf85Q96MD7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C9orf85Q96MD7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf85Q96MD7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf85Q96MD7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf85Q96MD7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf85Q96MD7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf85Q96MD7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf85Q96MD7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf85Q96MD7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C9orf85Q96MD7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf85Q96MD7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf85Q96MD7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf85Q96MD7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf85Q96MD7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf85Q96MD7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C9orf85Q96MD7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.1 ms