Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CCDC7Q96M83 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CCDC7Q96M83 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CCDC7Q96M83 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CCDC7Q96M83 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CCDC7Q96M83 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CCDC7Q96M83 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CCDC7Q96M83 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CCDC7Q96M83 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CCDC7Q96M83 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CCDC7Q96M83 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
CCDC7Q96M83 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.02
CCDC7Q96M83 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CCDC7Q96M83 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CCDC7Q96M83 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CCDC7Q96M83 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
CCDC7Q96M83 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CCDC7Q96M83 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CCDC7Q96M83 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
CCDC7Q96M83 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CCDC7Q96M83 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CCDC7Q96M83 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CCDC7Q96M83 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
CCDC7Q96M83 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CCDC7Q96M83 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CCDC7Q96M83 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CCDC7Q96M83 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CCDC7Q96M83 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
CCDC7Q96M83 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
CCDC7Q96M83 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CCDC7Q96M83 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
CCDC7Q96M83 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CCDC7Q96M83 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CCDC7Q96M83 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
CCDC7Q96M83 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CCDC7Q96M83 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CCDC7Q96M83 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CCDC7Q96M83 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CCDC7Q96M83 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CCDC7Q96M83 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CCDC7Q96M83 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CCDC7Q96M83 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CCDC7Q96M83 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CCDC7Q96M83 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CCDC7Q96M83 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CCDC7Q96M83 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CCDC7Q96M83 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CCDC7Q96M83 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CCDC7Q96M83 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CCDC7Q96M83 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CCDC7Q96M83 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CCDC7Q96M83 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CCDC7Q96M83 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CCDC7Q96M83 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CCDC7Q96M83 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CCDC7Q96M83 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CCDC7Q96M83 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
CCDC7Q96M83 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3.01
CCDC7Q96M83 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CCDC7Q96M83 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC33.82■■■■□ 3
CCDC7Q96M83 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CCDC7Q96M83 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CCDC7Q96M83 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CCDC7Q96M83 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CCDC7Q96M83 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
CCDC7Q96M83 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC33.8■■■■□ 3
CCDC7Q96M83 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CCDC7Q96M83 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CCDC7Q96M83 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
CCDC7Q96M83 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CCDC7Q96M83 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
CCDC7Q96M83 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CCDC7Q96M83 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC33.79■■■■□ 3
CCDC7Q96M83 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CCDC7Q96M83 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CCDC7Q96M83 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CCDC7Q96M83 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CCDC7Q96M83 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CCDC7Q96M83 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CCDC7Q96M83 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
CCDC7Q96M83 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CCDC7Q96M83 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CCDC7Q96M83 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CCDC7Q96M83 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
CCDC7Q96M83 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CCDC7Q96M83 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CCDC7Q96M83 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
CCDC7Q96M83 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
CCDC7Q96M83 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
CCDC7Q96M83 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
CCDC7Q96M83 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC33.76■■■■□ 3
CCDC7Q96M83 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
CCDC7Q96M83 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC33.76■■■■□ 3
CCDC7Q96M83 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
CCDC7Q96M83 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
CCDC7Q96M83 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
CCDC7Q96M83 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
CCDC7Q96M83 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CCDC7Q96M83 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CCDC7Q96M83 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms