Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIM47Q96LD4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIM47Q96LD4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIM47Q96LD4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIM47Q96LD4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIM47Q96LD4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIM47Q96LD4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIM47Q96LD4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRIM47Q96LD4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRIM47Q96LD4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRIM47Q96LD4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRIM47Q96LD4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRIM47Q96LD4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRIM47Q96LD4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRIM47Q96LD4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIM47Q96LD4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIM47Q96LD4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIM47Q96LD4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIM47Q96LD4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIM47Q96LD4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIM47Q96LD4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIM47Q96LD4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIM47Q96LD4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIM47Q96LD4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIM47Q96LD4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIM47Q96LD4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRIM47Q96LD4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRIM47Q96LD4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRIM47Q96LD4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRIM47Q96LD4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRIM47Q96LD4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRIM47Q96LD4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRIM47Q96LD4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRIM47Q96LD4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRIM47Q96LD4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRIM47Q96LD4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRIM47Q96LD4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRIM47Q96LD4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRIM47Q96LD4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRIM47Q96LD4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRIM47Q96LD4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRIM47Q96LD4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRIM47Q96LD4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
TRIM47Q96LD4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRIM47Q96LD4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRIM47Q96LD4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
TRIM47Q96LD4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRIM47Q96LD4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRIM47Q96LD4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRIM47Q96LD4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRIM47Q96LD4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRIM47Q96LD4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRIM47Q96LD4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRIM47Q96LD4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRIM47Q96LD4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIM47Q96LD4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIM47Q96LD4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIM47Q96LD4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIM47Q96LD4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRIM47Q96LD4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
TRIM47Q96LD4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRIM47Q96LD4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
TRIM47Q96LD4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRIM47Q96LD4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRIM47Q96LD4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRIM47Q96LD4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
TRIM47Q96LD4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRIM47Q96LD4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRIM47Q96LD4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRIM47Q96LD4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRIM47Q96LD4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRIM47Q96LD4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIM47Q96LD4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIM47Q96LD4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIM47Q96LD4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIM47Q96LD4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIM47Q96LD4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRIM47Q96LD4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRIM47Q96LD4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRIM47Q96LD4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRIM47Q96LD4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
TRIM47Q96LD4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRIM47Q96LD4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRIM47Q96LD4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRIM47Q96LD4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRIM47Q96LD4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRIM47Q96LD4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRIM47Q96LD4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRIM47Q96LD4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRIM47Q96LD4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
TRIM47Q96LD4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRIM47Q96LD4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRIM47Q96LD4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRIM47Q96LD4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRIM47Q96LD4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRIM47Q96LD4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRIM47Q96LD4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRIM47Q96LD4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRIM47Q96LD4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRIM47Q96LD4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms