Protein–RNA interactions for Protein: Q96GY3

LIN37, Protein lin-37 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN37Q96GY3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LIN37Q96GY3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LIN37Q96GY3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LIN37Q96GY3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LIN37Q96GY3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LIN37Q96GY3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LIN37Q96GY3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LIN37Q96GY3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LIN37Q96GY3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LIN37Q96GY3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LIN37Q96GY3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LIN37Q96GY3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LIN37Q96GY3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LIN37Q96GY3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LIN37Q96GY3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LIN37Q96GY3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LIN37Q96GY3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LIN37Q96GY3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LIN37Q96GY3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LIN37Q96GY3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LIN37Q96GY3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LIN37Q96GY3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
LIN37Q96GY3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LIN37Q96GY3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LIN37Q96GY3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LIN37Q96GY3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LIN37Q96GY3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LIN37Q96GY3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LIN37Q96GY3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LIN37Q96GY3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LIN37Q96GY3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LIN37Q96GY3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LIN37Q96GY3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LIN37Q96GY3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LIN37Q96GY3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LIN37Q96GY3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LIN37Q96GY3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LIN37Q96GY3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LIN37Q96GY3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LIN37Q96GY3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LIN37Q96GY3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LIN37Q96GY3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LIN37Q96GY3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LIN37Q96GY3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LIN37Q96GY3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LIN37Q96GY3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LIN37Q96GY3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LIN37Q96GY3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LIN37Q96GY3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LIN37Q96GY3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LIN37Q96GY3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LIN37Q96GY3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LIN37Q96GY3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LIN37Q96GY3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LIN37Q96GY3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LIN37Q96GY3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LIN37Q96GY3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LIN37Q96GY3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LIN37Q96GY3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LIN37Q96GY3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LIN37Q96GY3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
LIN37Q96GY3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LIN37Q96GY3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LIN37Q96GY3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LIN37Q96GY3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LIN37Q96GY3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LIN37Q96GY3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LIN37Q96GY3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LIN37Q96GY3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LIN37Q96GY3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LIN37Q96GY3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LIN37Q96GY3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LIN37Q96GY3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LIN37Q96GY3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LIN37Q96GY3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LIN37Q96GY3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LIN37Q96GY3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LIN37Q96GY3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LIN37Q96GY3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LIN37Q96GY3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LIN37Q96GY3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LIN37Q96GY3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LIN37Q96GY3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LIN37Q96GY3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LIN37Q96GY3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LIN37Q96GY3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LIN37Q96GY3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LIN37Q96GY3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LIN37Q96GY3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LIN37Q96GY3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
LIN37Q96GY3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LIN37Q96GY3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LIN37Q96GY3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
LIN37Q96GY3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LIN37Q96GY3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
LIN37Q96GY3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LIN37Q96GY3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
LIN37Q96GY3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LIN37Q96GY3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LIN37Q96GY3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 161.7 ms