Protein–RNA interactions for Protein: Q96FV3

TSPAN17, Tetraspanin-17, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN17Q96FV3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TSPAN17Q96FV3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TSPAN17Q96FV3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TSPAN17Q96FV3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TSPAN17Q96FV3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSPAN17Q96FV3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSPAN17Q96FV3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSPAN17Q96FV3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSPAN17Q96FV3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSPAN17Q96FV3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSPAN17Q96FV3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSPAN17Q96FV3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSPAN17Q96FV3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSPAN17Q96FV3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TSPAN17Q96FV3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TSPAN17Q96FV3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TSPAN17Q96FV3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TSPAN17Q96FV3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TSPAN17Q96FV3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TSPAN17Q96FV3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TSPAN17Q96FV3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSPAN17Q96FV3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSPAN17Q96FV3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSPAN17Q96FV3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSPAN17Q96FV3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSPAN17Q96FV3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TSPAN17Q96FV3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSPAN17Q96FV3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSPAN17Q96FV3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSPAN17Q96FV3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSPAN17Q96FV3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TSPAN17Q96FV3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TSPAN17Q96FV3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TSPAN17Q96FV3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TSPAN17Q96FV3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TSPAN17Q96FV3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSPAN17Q96FV3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSPAN17Q96FV3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSPAN17Q96FV3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSPAN17Q96FV3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSPAN17Q96FV3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSPAN17Q96FV3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TSPAN17Q96FV3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TSPAN17Q96FV3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TSPAN17Q96FV3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TSPAN17Q96FV3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TSPAN17Q96FV3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TSPAN17Q96FV3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TSPAN17Q96FV3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TSPAN17Q96FV3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TSPAN17Q96FV3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TSPAN17Q96FV3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TSPAN17Q96FV3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TSPAN17Q96FV3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TSPAN17Q96FV3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TSPAN17Q96FV3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TSPAN17Q96FV3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TSPAN17Q96FV3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TSPAN17Q96FV3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TSPAN17Q96FV3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TSPAN17Q96FV3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TSPAN17Q96FV3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TSPAN17Q96FV3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TSPAN17Q96FV3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TSPAN17Q96FV3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TSPAN17Q96FV3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TSPAN17Q96FV3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TSPAN17Q96FV3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TSPAN17Q96FV3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TSPAN17Q96FV3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TSPAN17Q96FV3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TSPAN17Q96FV3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TSPAN17Q96FV3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TSPAN17Q96FV3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TSPAN17Q96FV3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TSPAN17Q96FV3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TSPAN17Q96FV3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TSPAN17Q96FV3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TSPAN17Q96FV3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TSPAN17Q96FV3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TSPAN17Q96FV3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TSPAN17Q96FV3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TSPAN17Q96FV3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TSPAN17Q96FV3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TSPAN17Q96FV3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TSPAN17Q96FV3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TSPAN17Q96FV3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TSPAN17Q96FV3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TSPAN17Q96FV3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TSPAN17Q96FV3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TSPAN17Q96FV3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TSPAN17Q96FV3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TSPAN17Q96FV3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TSPAN17Q96FV3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TSPAN17Q96FV3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TSPAN17Q96FV3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TSPAN17Q96FV3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TSPAN17Q96FV3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TSPAN17Q96FV3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TSPAN17Q96FV3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms