Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH8

NEURL3, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL3, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL3Q96EH8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NEURL3Q96EH8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NEURL3Q96EH8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEURL3Q96EH8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NEURL3Q96EH8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEURL3Q96EH8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEURL3Q96EH8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEURL3Q96EH8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEURL3Q96EH8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEURL3Q96EH8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEURL3Q96EH8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEURL3Q96EH8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEURL3Q96EH8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEURL3Q96EH8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEURL3Q96EH8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEURL3Q96EH8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEURL3Q96EH8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEURL3Q96EH8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEURL3Q96EH8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEURL3Q96EH8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEURL3Q96EH8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEURL3Q96EH8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEURL3Q96EH8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEURL3Q96EH8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEURL3Q96EH8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEURL3Q96EH8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEURL3Q96EH8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEURL3Q96EH8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEURL3Q96EH8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEURL3Q96EH8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEURL3Q96EH8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEURL3Q96EH8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEURL3Q96EH8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEURL3Q96EH8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEURL3Q96EH8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEURL3Q96EH8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEURL3Q96EH8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEURL3Q96EH8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEURL3Q96EH8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEURL3Q96EH8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEURL3Q96EH8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEURL3Q96EH8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEURL3Q96EH8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEURL3Q96EH8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEURL3Q96EH8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEURL3Q96EH8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEURL3Q96EH8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEURL3Q96EH8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NEURL3Q96EH8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEURL3Q96EH8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEURL3Q96EH8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEURL3Q96EH8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEURL3Q96EH8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEURL3Q96EH8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEURL3Q96EH8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEURL3Q96EH8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
NEURL3Q96EH8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NEURL3Q96EH8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NEURL3Q96EH8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEURL3Q96EH8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEURL3Q96EH8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEURL3Q96EH8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEURL3Q96EH8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEURL3Q96EH8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NEURL3Q96EH8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEURL3Q96EH8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEURL3Q96EH8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEURL3Q96EH8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEURL3Q96EH8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEURL3Q96EH8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NEURL3Q96EH8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEURL3Q96EH8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEURL3Q96EH8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEURL3Q96EH8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEURL3Q96EH8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEURL3Q96EH8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEURL3Q96EH8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEURL3Q96EH8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEURL3Q96EH8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEURL3Q96EH8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEURL3Q96EH8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEURL3Q96EH8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NEURL3Q96EH8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEURL3Q96EH8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEURL3Q96EH8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NEURL3Q96EH8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEURL3Q96EH8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEURL3Q96EH8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEURL3Q96EH8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEURL3Q96EH8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEURL3Q96EH8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEURL3Q96EH8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEURL3Q96EH8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEURL3Q96EH8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEURL3Q96EH8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
NEURL3Q96EH8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEURL3Q96EH8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEURL3Q96EH8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEURL3Q96EH8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEURL3Q96EH8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms