Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX8

RTP4, Receptor-transporting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP4Q96DX8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RTP4Q96DX8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RTP4Q96DX8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RTP4Q96DX8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RTP4Q96DX8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RTP4Q96DX8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RTP4Q96DX8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RTP4Q96DX8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RTP4Q96DX8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RTP4Q96DX8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RTP4Q96DX8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RTP4Q96DX8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RTP4Q96DX8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RTP4Q96DX8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RTP4Q96DX8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RTP4Q96DX8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RTP4Q96DX8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RTP4Q96DX8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RTP4Q96DX8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RTP4Q96DX8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RTP4Q96DX8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RTP4Q96DX8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RTP4Q96DX8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RTP4Q96DX8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RTP4Q96DX8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RTP4Q96DX8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RTP4Q96DX8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RTP4Q96DX8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RTP4Q96DX8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RTP4Q96DX8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RTP4Q96DX8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RTP4Q96DX8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RTP4Q96DX8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RTP4Q96DX8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RTP4Q96DX8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RTP4Q96DX8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RTP4Q96DX8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RTP4Q96DX8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RTP4Q96DX8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RTP4Q96DX8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RTP4Q96DX8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RTP4Q96DX8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RTP4Q96DX8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RTP4Q96DX8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RTP4Q96DX8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RTP4Q96DX8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RTP4Q96DX8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RTP4Q96DX8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RTP4Q96DX8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RTP4Q96DX8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RTP4Q96DX8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RTP4Q96DX8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RTP4Q96DX8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RTP4Q96DX8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RTP4Q96DX8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RTP4Q96DX8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RTP4Q96DX8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RTP4Q96DX8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RTP4Q96DX8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RTP4Q96DX8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RTP4Q96DX8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RTP4Q96DX8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RTP4Q96DX8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RTP4Q96DX8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RTP4Q96DX8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RTP4Q96DX8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RTP4Q96DX8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RTP4Q96DX8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RTP4Q96DX8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RTP4Q96DX8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RTP4Q96DX8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RTP4Q96DX8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RTP4Q96DX8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RTP4Q96DX8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RTP4Q96DX8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RTP4Q96DX8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RTP4Q96DX8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RTP4Q96DX8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RTP4Q96DX8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RTP4Q96DX8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RTP4Q96DX8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RTP4Q96DX8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RTP4Q96DX8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RTP4Q96DX8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RTP4Q96DX8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RTP4Q96DX8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RTP4Q96DX8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RTP4Q96DX8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RTP4Q96DX8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RTP4Q96DX8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RTP4Q96DX8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RTP4Q96DX8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RTP4Q96DX8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RTP4Q96DX8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RTP4Q96DX8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RTP4Q96DX8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RTP4Q96DX8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RTP4Q96DX8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RTP4Q96DX8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RTP4Q96DX8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms