Protein–RNA interactions for Protein: Q96C74

ROPN1L, Ropporin-1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1LQ96C74 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ROPN1LQ96C74 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ROPN1LQ96C74 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ROPN1LQ96C74 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ROPN1LQ96C74 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ROPN1LQ96C74 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ROPN1LQ96C74 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ROPN1LQ96C74 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ROPN1LQ96C74 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ROPN1LQ96C74 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ROPN1LQ96C74 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ROPN1LQ96C74 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ROPN1LQ96C74 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ROPN1LQ96C74 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ROPN1LQ96C74 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ROPN1LQ96C74 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ROPN1LQ96C74 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ROPN1LQ96C74 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ROPN1LQ96C74 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ROPN1LQ96C74 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ROPN1LQ96C74 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ROPN1LQ96C74 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ROPN1LQ96C74 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ROPN1LQ96C74 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ROPN1LQ96C74 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ROPN1LQ96C74 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ROPN1LQ96C74 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ROPN1LQ96C74 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ROPN1LQ96C74 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ROPN1LQ96C74 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ROPN1LQ96C74 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ROPN1LQ96C74 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ROPN1LQ96C74 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ROPN1LQ96C74 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ROPN1LQ96C74 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ROPN1LQ96C74 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ROPN1LQ96C74 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ROPN1LQ96C74 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ROPN1LQ96C74 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ROPN1LQ96C74 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ROPN1LQ96C74 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ROPN1LQ96C74 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ROPN1LQ96C74 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ROPN1LQ96C74 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ROPN1LQ96C74 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ROPN1LQ96C74 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ROPN1LQ96C74 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ROPN1LQ96C74 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ROPN1LQ96C74 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ROPN1LQ96C74 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ROPN1LQ96C74 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ROPN1LQ96C74 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ROPN1LQ96C74 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ROPN1LQ96C74 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ROPN1LQ96C74 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ROPN1LQ96C74 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ROPN1LQ96C74 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ROPN1LQ96C74 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ROPN1LQ96C74 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ROPN1LQ96C74 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ROPN1LQ96C74 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ROPN1LQ96C74 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ROPN1LQ96C74 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ROPN1LQ96C74 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ROPN1LQ96C74 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ROPN1LQ96C74 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ROPN1LQ96C74 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ROPN1LQ96C74 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ROPN1LQ96C74 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ROPN1LQ96C74 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ROPN1LQ96C74 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ROPN1LQ96C74 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ROPN1LQ96C74 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ROPN1LQ96C74 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ROPN1LQ96C74 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ROPN1LQ96C74 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ROPN1LQ96C74 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ROPN1LQ96C74 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ROPN1LQ96C74 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ROPN1LQ96C74 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ROPN1LQ96C74 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ROPN1LQ96C74 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ROPN1LQ96C74 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ROPN1LQ96C74 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ROPN1LQ96C74 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ROPN1LQ96C74 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ROPN1LQ96C74 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ROPN1LQ96C74 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ROPN1LQ96C74 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ROPN1LQ96C74 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ROPN1LQ96C74 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ROPN1LQ96C74 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ROPN1LQ96C74 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ROPN1LQ96C74 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ROPN1LQ96C74 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ROPN1LQ96C74 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ROPN1LQ96C74 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ROPN1LQ96C74 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ROPN1LQ96C74 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ROPN1LQ96C74 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms