Protein–RNA interactions for Protein: Q93009

USP7, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP7Q93009 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP7Q93009 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP7Q93009 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP7Q93009 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP7Q93009 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP7Q93009 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP7Q93009 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP7Q93009 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP7Q93009 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP7Q93009 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP7Q93009 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP7Q93009 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP7Q93009 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP7Q93009 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP7Q93009 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP7Q93009 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP7Q93009 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP7Q93009 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP7Q93009 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP7Q93009 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP7Q93009 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP7Q93009 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
USP7Q93009 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP7Q93009 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP7Q93009 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP7Q93009 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP7Q93009 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP7Q93009 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP7Q93009 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP7Q93009 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP7Q93009 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP7Q93009 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP7Q93009 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP7Q93009 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
USP7Q93009 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP7Q93009 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP7Q93009 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP7Q93009 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP7Q93009 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP7Q93009 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP7Q93009 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP7Q93009 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP7Q93009 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP7Q93009 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP7Q93009 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP7Q93009 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP7Q93009 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP7Q93009 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP7Q93009 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP7Q93009 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP7Q93009 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP7Q93009 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP7Q93009 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP7Q93009 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP7Q93009 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
USP7Q93009 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP7Q93009 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP7Q93009 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP7Q93009 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP7Q93009 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
USP7Q93009 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP7Q93009 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP7Q93009 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP7Q93009 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP7Q93009 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP7Q93009 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP7Q93009 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP7Q93009 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
USP7Q93009 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP7Q93009 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP7Q93009 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP7Q93009 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP7Q93009 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP7Q93009 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP7Q93009 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
USP7Q93009 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP7Q93009 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
USP7Q93009 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP7Q93009 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP7Q93009 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP7Q93009 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP7Q93009 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
USP7Q93009 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP7Q93009 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP7Q93009 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP7Q93009 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP7Q93009 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP7Q93009 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP7Q93009 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP7Q93009 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP7Q93009 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP7Q93009 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP7Q93009 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP7Q93009 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP7Q93009 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP7Q93009 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
USP7Q93009 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
USP7Q93009 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP7Q93009 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP7Q93009 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms