Protein–RNA interactions for Protein: Q93008

USP9X, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,570 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9XQ93008 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP9XQ93008 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP9XQ93008 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
USP9XQ93008 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
USP9XQ93008 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
USP9XQ93008 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP9XQ93008 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP9XQ93008 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP9XQ93008 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP9XQ93008 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP9XQ93008 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP9XQ93008 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP9XQ93008 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP9XQ93008 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP9XQ93008 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP9XQ93008 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP9XQ93008 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP9XQ93008 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP9XQ93008 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP9XQ93008 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP9XQ93008 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP9XQ93008 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP9XQ93008 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.04
USP9XQ93008 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
USP9XQ93008 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
USP9XQ93008 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP9XQ93008 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP9XQ93008 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP9XQ93008 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
USP9XQ93008 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP9XQ93008 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP9XQ93008 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
USP9XQ93008 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP9XQ93008 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
USP9XQ93008 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP9XQ93008 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP9XQ93008 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP9XQ93008 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP9XQ93008 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP9XQ93008 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP9XQ93008 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP9XQ93008 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP9XQ93008 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP9XQ93008 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP9XQ93008 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP9XQ93008 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
USP9XQ93008 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP9XQ93008 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP9XQ93008 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP9XQ93008 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
USP9XQ93008 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP9XQ93008 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP9XQ93008 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP9XQ93008 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP9XQ93008 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
USP9XQ93008 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP9XQ93008 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP9XQ93008 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP9XQ93008 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP9XQ93008 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP9XQ93008 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP9XQ93008 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP9XQ93008 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP9XQ93008 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP9XQ93008 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP9XQ93008 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP9XQ93008 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
USP9XQ93008 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
USP9XQ93008 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP9XQ93008 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP9XQ93008 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP9XQ93008 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP9XQ93008 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP9XQ93008 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP9XQ93008 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP9XQ93008 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP9XQ93008 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP9XQ93008 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP9XQ93008 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
USP9XQ93008 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP9XQ93008 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP9XQ93008 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP9XQ93008 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP9XQ93008 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP9XQ93008 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
USP9XQ93008 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
USP9XQ93008 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP9XQ93008 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP9XQ93008 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP9XQ93008 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP9XQ93008 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP9XQ93008 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP9XQ93008 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP9XQ93008 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP9XQ93008 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP9XQ93008 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP9XQ93008 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP9XQ93008 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP9XQ93008 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP9XQ93008 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
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