Protein–RNA interactions for Protein: Q92542

NCSTN, Nicastrin, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCSTNQ92542 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NCSTNQ92542 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NCSTNQ92542 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NCSTNQ92542 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NCSTNQ92542 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NCSTNQ92542 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NCSTNQ92542 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NCSTNQ92542 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NCSTNQ92542 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NCSTNQ92542 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NCSTNQ92542 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NCSTNQ92542 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
NCSTNQ92542 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
NCSTNQ92542 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NCSTNQ92542 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NCSTNQ92542 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NCSTNQ92542 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NCSTNQ92542 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NCSTNQ92542 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NCSTNQ92542 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NCSTNQ92542 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NCSTNQ92542 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NCSTNQ92542 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NCSTNQ92542 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NCSTNQ92542 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NCSTNQ92542 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NCSTNQ92542 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NCSTNQ92542 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NCSTNQ92542 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NCSTNQ92542 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NCSTNQ92542 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NCSTNQ92542 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NCSTNQ92542 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NCSTNQ92542 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NCSTNQ92542 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NCSTNQ92542 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NCSTNQ92542 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NCSTNQ92542 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NCSTNQ92542 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NCSTNQ92542 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NCSTNQ92542 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NCSTNQ92542 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NCSTNQ92542 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NCSTNQ92542 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NCSTNQ92542 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NCSTNQ92542 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NCSTNQ92542 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NCSTNQ92542 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NCSTNQ92542 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NCSTNQ92542 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NCSTNQ92542 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NCSTNQ92542 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NCSTNQ92542 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NCSTNQ92542 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
NCSTNQ92542 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NCSTNQ92542 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NCSTNQ92542 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NCSTNQ92542 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
NCSTNQ92542 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NCSTNQ92542 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NCSTNQ92542 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NCSTNQ92542 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NCSTNQ92542 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NCSTNQ92542 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NCSTNQ92542 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NCSTNQ92542 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NCSTNQ92542 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NCSTNQ92542 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NCSTNQ92542 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NCSTNQ92542 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NCSTNQ92542 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NCSTNQ92542 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NCSTNQ92542 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NCSTNQ92542 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NCSTNQ92542 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NCSTNQ92542 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NCSTNQ92542 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NCSTNQ92542 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NCSTNQ92542 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NCSTNQ92542 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NCSTNQ92542 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NCSTNQ92542 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NCSTNQ92542 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NCSTNQ92542 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NCSTNQ92542 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NCSTNQ92542 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NCSTNQ92542 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NCSTNQ92542 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NCSTNQ92542 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NCSTNQ92542 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NCSTNQ92542 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NCSTNQ92542 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NCSTNQ92542 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NCSTNQ92542 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NCSTNQ92542 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NCSTNQ92542 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NCSTNQ92542 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NCSTNQ92542 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NCSTNQ92542 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NCSTNQ92542 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms