Protein–RNA interactions for Protein: Q92484

SMPDL3A, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3a, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3AQ92484 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMPDL3AQ92484 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMPDL3AQ92484 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMPDL3AQ92484 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMPDL3AQ92484 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMPDL3AQ92484 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMPDL3AQ92484 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMPDL3AQ92484 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMPDL3AQ92484 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMPDL3AQ92484 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMPDL3AQ92484 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMPDL3AQ92484 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMPDL3AQ92484 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMPDL3AQ92484 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMPDL3AQ92484 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMPDL3AQ92484 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMPDL3AQ92484 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMPDL3AQ92484 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMPDL3AQ92484 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMPDL3AQ92484 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SMPDL3AQ92484 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SMPDL3AQ92484 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMPDL3AQ92484 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMPDL3AQ92484 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMPDL3AQ92484 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMPDL3AQ92484 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMPDL3AQ92484 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMPDL3AQ92484 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMPDL3AQ92484 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMPDL3AQ92484 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMPDL3AQ92484 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMPDL3AQ92484 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMPDL3AQ92484 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMPDL3AQ92484 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMPDL3AQ92484 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMPDL3AQ92484 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMPDL3AQ92484 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMPDL3AQ92484 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMPDL3AQ92484 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMPDL3AQ92484 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMPDL3AQ92484 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMPDL3AQ92484 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMPDL3AQ92484 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMPDL3AQ92484 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SMPDL3AQ92484 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SMPDL3AQ92484 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMPDL3AQ92484 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMPDL3AQ92484 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMPDL3AQ92484 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMPDL3AQ92484 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMPDL3AQ92484 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMPDL3AQ92484 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMPDL3AQ92484 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMPDL3AQ92484 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMPDL3AQ92484 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SMPDL3AQ92484 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMPDL3AQ92484 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SMPDL3AQ92484 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMPDL3AQ92484 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMPDL3AQ92484 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMPDL3AQ92484 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMPDL3AQ92484 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMPDL3AQ92484 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMPDL3AQ92484 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMPDL3AQ92484 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMPDL3AQ92484 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMPDL3AQ92484 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMPDL3AQ92484 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SMPDL3AQ92484 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMPDL3AQ92484 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMPDL3AQ92484 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMPDL3AQ92484 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMPDL3AQ92484 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMPDL3AQ92484 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMPDL3AQ92484 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SMPDL3AQ92484 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMPDL3AQ92484 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMPDL3AQ92484 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SMPDL3AQ92484 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMPDL3AQ92484 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMPDL3AQ92484 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMPDL3AQ92484 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMPDL3AQ92484 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMPDL3AQ92484 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMPDL3AQ92484 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMPDL3AQ92484 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMPDL3AQ92484 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMPDL3AQ92484 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SMPDL3AQ92484 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMPDL3AQ92484 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMPDL3AQ92484 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SMPDL3AQ92484 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMPDL3AQ92484 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SMPDL3AQ92484 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMPDL3AQ92484 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMPDL3AQ92484 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMPDL3AQ92484 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMPDL3AQ92484 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMPDL3AQ92484 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMPDL3AQ92484 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.6 ms