Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVY7

UBLCP1, Ubiquitin-like domain-containing CTD phosphatase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBLCP1Q8WVY7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBLCP1Q8WVY7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBLCP1Q8WVY7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBLCP1Q8WVY7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBLCP1Q8WVY7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBLCP1Q8WVY7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBLCP1Q8WVY7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBLCP1Q8WVY7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBLCP1Q8WVY7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBLCP1Q8WVY7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBLCP1Q8WVY7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBLCP1Q8WVY7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBLCP1Q8WVY7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBLCP1Q8WVY7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBLCP1Q8WVY7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBLCP1Q8WVY7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBLCP1Q8WVY7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBLCP1Q8WVY7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBLCP1Q8WVY7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
UBLCP1Q8WVY7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBLCP1Q8WVY7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBLCP1Q8WVY7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBLCP1Q8WVY7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBLCP1Q8WVY7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBLCP1Q8WVY7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBLCP1Q8WVY7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBLCP1Q8WVY7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBLCP1Q8WVY7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBLCP1Q8WVY7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
UBLCP1Q8WVY7 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBLCP1Q8WVY7 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBLCP1Q8WVY7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBLCP1Q8WVY7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
UBLCP1Q8WVY7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBLCP1Q8WVY7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBLCP1Q8WVY7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBLCP1Q8WVY7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBLCP1Q8WVY7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBLCP1Q8WVY7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBLCP1Q8WVY7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBLCP1Q8WVY7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBLCP1Q8WVY7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBLCP1Q8WVY7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBLCP1Q8WVY7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBLCP1Q8WVY7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBLCP1Q8WVY7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBLCP1Q8WVY7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBLCP1Q8WVY7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBLCP1Q8WVY7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBLCP1Q8WVY7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBLCP1Q8WVY7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBLCP1Q8WVY7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBLCP1Q8WVY7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBLCP1Q8WVY7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
UBLCP1Q8WVY7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBLCP1Q8WVY7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBLCP1Q8WVY7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBLCP1Q8WVY7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBLCP1Q8WVY7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBLCP1Q8WVY7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBLCP1Q8WVY7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBLCP1Q8WVY7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBLCP1Q8WVY7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBLCP1Q8WVY7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBLCP1Q8WVY7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBLCP1Q8WVY7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBLCP1Q8WVY7 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBLCP1Q8WVY7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBLCP1Q8WVY7 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBLCP1Q8WVY7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
UBLCP1Q8WVY7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBLCP1Q8WVY7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBLCP1Q8WVY7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBLCP1Q8WVY7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBLCP1Q8WVY7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBLCP1Q8WVY7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBLCP1Q8WVY7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBLCP1Q8WVY7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBLCP1Q8WVY7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBLCP1Q8WVY7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBLCP1Q8WVY7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBLCP1Q8WVY7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBLCP1Q8WVY7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBLCP1Q8WVY7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBLCP1Q8WVY7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBLCP1Q8WVY7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBLCP1Q8WVY7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBLCP1Q8WVY7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBLCP1Q8WVY7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBLCP1Q8WVY7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBLCP1Q8WVY7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
UBLCP1Q8WVY7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
UBLCP1Q8WVY7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBLCP1Q8WVY7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBLCP1Q8WVY7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBLCP1Q8WVY7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBLCP1Q8WVY7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBLCP1Q8WVY7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBLCP1Q8WVY7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBLCP1Q8WVY7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms