Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD1

RAB2B, Ras-related protein Rab-2B, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB2BQ8WUD1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB2BQ8WUD1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB2BQ8WUD1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB2BQ8WUD1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB2BQ8WUD1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB2BQ8WUD1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB2BQ8WUD1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB2BQ8WUD1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB2BQ8WUD1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
RAB2BQ8WUD1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB2BQ8WUD1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB2BQ8WUD1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB2BQ8WUD1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB2BQ8WUD1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB2BQ8WUD1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB2BQ8WUD1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB2BQ8WUD1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB2BQ8WUD1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB2BQ8WUD1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB2BQ8WUD1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB2BQ8WUD1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB2BQ8WUD1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB2BQ8WUD1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB2BQ8WUD1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB2BQ8WUD1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB2BQ8WUD1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB2BQ8WUD1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB2BQ8WUD1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB2BQ8WUD1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB2BQ8WUD1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB2BQ8WUD1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB2BQ8WUD1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB2BQ8WUD1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB2BQ8WUD1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB2BQ8WUD1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB2BQ8WUD1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB2BQ8WUD1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB2BQ8WUD1 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB2BQ8WUD1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB2BQ8WUD1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB2BQ8WUD1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB2BQ8WUD1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB2BQ8WUD1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB2BQ8WUD1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB2BQ8WUD1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB2BQ8WUD1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB2BQ8WUD1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB2BQ8WUD1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB2BQ8WUD1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB2BQ8WUD1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB2BQ8WUD1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB2BQ8WUD1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB2BQ8WUD1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB2BQ8WUD1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB2BQ8WUD1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB2BQ8WUD1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB2BQ8WUD1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB2BQ8WUD1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB2BQ8WUD1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB2BQ8WUD1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB2BQ8WUD1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB2BQ8WUD1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB2BQ8WUD1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB2BQ8WUD1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB2BQ8WUD1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB2BQ8WUD1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB2BQ8WUD1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB2BQ8WUD1 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB2BQ8WUD1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB2BQ8WUD1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB2BQ8WUD1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB2BQ8WUD1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB2BQ8WUD1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB2BQ8WUD1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB2BQ8WUD1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB2BQ8WUD1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB2BQ8WUD1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB2BQ8WUD1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB2BQ8WUD1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB2BQ8WUD1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB2BQ8WUD1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB2BQ8WUD1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB2BQ8WUD1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RAB2BQ8WUD1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RAB2BQ8WUD1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB2BQ8WUD1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB2BQ8WUD1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB2BQ8WUD1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB2BQ8WUD1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB2BQ8WUD1 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB2BQ8WUD1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB2BQ8WUD1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB2BQ8WUD1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB2BQ8WUD1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB2BQ8WUD1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB2BQ8WUD1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB2BQ8WUD1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB2BQ8WUD1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB2BQ8WUD1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB2BQ8WUD1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms