Protein–RNA interactions for Protein: Q8WU68

U2AF1L4, Splicing factor U2AF 26 kDa subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L4Q8WU68 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
U2AF1L4Q8WU68 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
U2AF1L4Q8WU68 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
U2AF1L4Q8WU68 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
U2AF1L4Q8WU68 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
U2AF1L4Q8WU68 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
U2AF1L4Q8WU68 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
U2AF1L4Q8WU68 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
U2AF1L4Q8WU68 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
U2AF1L4Q8WU68 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
U2AF1L4Q8WU68 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
U2AF1L4Q8WU68 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
U2AF1L4Q8WU68 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
U2AF1L4Q8WU68 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
U2AF1L4Q8WU68 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
U2AF1L4Q8WU68 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
U2AF1L4Q8WU68 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
U2AF1L4Q8WU68 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
U2AF1L4Q8WU68 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
U2AF1L4Q8WU68 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
U2AF1L4Q8WU68 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
U2AF1L4Q8WU68 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
U2AF1L4Q8WU68 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
U2AF1L4Q8WU68 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
U2AF1L4Q8WU68 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
U2AF1L4Q8WU68 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
U2AF1L4Q8WU68 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
U2AF1L4Q8WU68 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
U2AF1L4Q8WU68 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
U2AF1L4Q8WU68 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
U2AF1L4Q8WU68 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
U2AF1L4Q8WU68 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
U2AF1L4Q8WU68 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
U2AF1L4Q8WU68 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
U2AF1L4Q8WU68 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
U2AF1L4Q8WU68 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
U2AF1L4Q8WU68 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
U2AF1L4Q8WU68 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
U2AF1L4Q8WU68 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
U2AF1L4Q8WU68 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
U2AF1L4Q8WU68 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
U2AF1L4Q8WU68 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
U2AF1L4Q8WU68 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
U2AF1L4Q8WU68 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
U2AF1L4Q8WU68 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
U2AF1L4Q8WU68 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
U2AF1L4Q8WU68 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
U2AF1L4Q8WU68 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
U2AF1L4Q8WU68 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
U2AF1L4Q8WU68 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
U2AF1L4Q8WU68 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
U2AF1L4Q8WU68 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
U2AF1L4Q8WU68 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
U2AF1L4Q8WU68 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
U2AF1L4Q8WU68 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
U2AF1L4Q8WU68 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
U2AF1L4Q8WU68 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
U2AF1L4Q8WU68 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
U2AF1L4Q8WU68 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
U2AF1L4Q8WU68 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
U2AF1L4Q8WU68 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
U2AF1L4Q8WU68 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
U2AF1L4Q8WU68 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
U2AF1L4Q8WU68 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
U2AF1L4Q8WU68 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
U2AF1L4Q8WU68 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
U2AF1L4Q8WU68 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
U2AF1L4Q8WU68 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
U2AF1L4Q8WU68 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
U2AF1L4Q8WU68 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
U2AF1L4Q8WU68 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
U2AF1L4Q8WU68 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
U2AF1L4Q8WU68 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
U2AF1L4Q8WU68 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
U2AF1L4Q8WU68 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
U2AF1L4Q8WU68 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
U2AF1L4Q8WU68 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
U2AF1L4Q8WU68 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
U2AF1L4Q8WU68 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
U2AF1L4Q8WU68 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
U2AF1L4Q8WU68 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
U2AF1L4Q8WU68 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
U2AF1L4Q8WU68 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
U2AF1L4Q8WU68 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
U2AF1L4Q8WU68 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
U2AF1L4Q8WU68 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
U2AF1L4Q8WU68 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
U2AF1L4Q8WU68 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
U2AF1L4Q8WU68 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
U2AF1L4Q8WU68 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
U2AF1L4Q8WU68 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
U2AF1L4Q8WU68 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
U2AF1L4Q8WU68 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
U2AF1L4Q8WU68 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
U2AF1L4Q8WU68 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
U2AF1L4Q8WU68 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
U2AF1L4Q8WU68 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
U2AF1L4Q8WU68 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
U2AF1L4Q8WU68 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
U2AF1L4Q8WU68 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.8 ms