Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEM2

SHCBP1, SHC SH2 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHCBP1Q8NEM2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SHCBP1Q8NEM2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SHCBP1Q8NEM2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SHCBP1Q8NEM2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SHCBP1Q8NEM2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SHCBP1Q8NEM2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SHCBP1Q8NEM2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SHCBP1Q8NEM2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SHCBP1Q8NEM2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SHCBP1Q8NEM2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SHCBP1Q8NEM2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SHCBP1Q8NEM2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
SHCBP1Q8NEM2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SHCBP1Q8NEM2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SHCBP1Q8NEM2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SHCBP1Q8NEM2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
SHCBP1Q8NEM2 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SHCBP1Q8NEM2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SHCBP1Q8NEM2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SHCBP1Q8NEM2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SHCBP1Q8NEM2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SHCBP1Q8NEM2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SHCBP1Q8NEM2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SHCBP1Q8NEM2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SHCBP1Q8NEM2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SHCBP1Q8NEM2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SHCBP1Q8NEM2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SHCBP1Q8NEM2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SHCBP1Q8NEM2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SHCBP1Q8NEM2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SHCBP1Q8NEM2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SHCBP1Q8NEM2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SHCBP1Q8NEM2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SHCBP1Q8NEM2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SHCBP1Q8NEM2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SHCBP1Q8NEM2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SHCBP1Q8NEM2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SHCBP1Q8NEM2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SHCBP1Q8NEM2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SHCBP1Q8NEM2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SHCBP1Q8NEM2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SHCBP1Q8NEM2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SHCBP1Q8NEM2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SHCBP1Q8NEM2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SHCBP1Q8NEM2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SHCBP1Q8NEM2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SHCBP1Q8NEM2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SHCBP1Q8NEM2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SHCBP1Q8NEM2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SHCBP1Q8NEM2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SHCBP1Q8NEM2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SHCBP1Q8NEM2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SHCBP1Q8NEM2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SHCBP1Q8NEM2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SHCBP1Q8NEM2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SHCBP1Q8NEM2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SHCBP1Q8NEM2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SHCBP1Q8NEM2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SHCBP1Q8NEM2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SHCBP1Q8NEM2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SHCBP1Q8NEM2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SHCBP1Q8NEM2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SHCBP1Q8NEM2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SHCBP1Q8NEM2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SHCBP1Q8NEM2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SHCBP1Q8NEM2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SHCBP1Q8NEM2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SHCBP1Q8NEM2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SHCBP1Q8NEM2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SHCBP1Q8NEM2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SHCBP1Q8NEM2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SHCBP1Q8NEM2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SHCBP1Q8NEM2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SHCBP1Q8NEM2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
SHCBP1Q8NEM2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SHCBP1Q8NEM2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SHCBP1Q8NEM2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SHCBP1Q8NEM2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SHCBP1Q8NEM2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SHCBP1Q8NEM2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SHCBP1Q8NEM2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SHCBP1Q8NEM2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SHCBP1Q8NEM2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SHCBP1Q8NEM2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SHCBP1Q8NEM2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SHCBP1Q8NEM2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SHCBP1Q8NEM2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SHCBP1Q8NEM2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SHCBP1Q8NEM2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
SHCBP1Q8NEM2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
SHCBP1Q8NEM2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SHCBP1Q8NEM2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SHCBP1Q8NEM2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SHCBP1Q8NEM2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SHCBP1Q8NEM2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SHCBP1Q8NEM2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SHCBP1Q8NEM2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SHCBP1Q8NEM2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SHCBP1Q8NEM2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SHCBP1Q8NEM2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms