Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND30

PPFIBP2, Liprin-beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 876 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP2Q8ND30 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPFIBP2Q8ND30 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPFIBP2Q8ND30 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPFIBP2Q8ND30 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPFIBP2Q8ND30 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPFIBP2Q8ND30 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPFIBP2Q8ND30 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPFIBP2Q8ND30 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPFIBP2Q8ND30 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPFIBP2Q8ND30 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPFIBP2Q8ND30 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPFIBP2Q8ND30 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPFIBP2Q8ND30 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPFIBP2Q8ND30 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPFIBP2Q8ND30 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPFIBP2Q8ND30 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPFIBP2Q8ND30 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPFIBP2Q8ND30 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPFIBP2Q8ND30 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPFIBP2Q8ND30 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PPFIBP2Q8ND30 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPFIBP2Q8ND30 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPFIBP2Q8ND30 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPFIBP2Q8ND30 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPFIBP2Q8ND30 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPFIBP2Q8ND30 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPFIBP2Q8ND30 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPFIBP2Q8ND30 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPFIBP2Q8ND30 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPFIBP2Q8ND30 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPFIBP2Q8ND30 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PPFIBP2Q8ND30 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PPFIBP2Q8ND30 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPFIBP2Q8ND30 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPFIBP2Q8ND30 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPFIBP2Q8ND30 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPFIBP2Q8ND30 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPFIBP2Q8ND30 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPFIBP2Q8ND30 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPFIBP2Q8ND30 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPFIBP2Q8ND30 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPFIBP2Q8ND30 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPFIBP2Q8ND30 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPFIBP2Q8ND30 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPFIBP2Q8ND30 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPFIBP2Q8ND30 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPFIBP2Q8ND30 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPFIBP2Q8ND30 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPFIBP2Q8ND30 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPFIBP2Q8ND30 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPFIBP2Q8ND30 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPFIBP2Q8ND30 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPFIBP2Q8ND30 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPFIBP2Q8ND30 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPFIBP2Q8ND30 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PPFIBP2Q8ND30 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPFIBP2Q8ND30 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPFIBP2Q8ND30 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPFIBP2Q8ND30 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPFIBP2Q8ND30 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPFIBP2Q8ND30 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPFIBP2Q8ND30 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPFIBP2Q8ND30 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPFIBP2Q8ND30 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPFIBP2Q8ND30 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPFIBP2Q8ND30 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPFIBP2Q8ND30 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPFIBP2Q8ND30 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPFIBP2Q8ND30 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPFIBP2Q8ND30 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPFIBP2Q8ND30 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPFIBP2Q8ND30 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPFIBP2Q8ND30 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPFIBP2Q8ND30 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPFIBP2Q8ND30 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPFIBP2Q8ND30 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPFIBP2Q8ND30 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPFIBP2Q8ND30 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PPFIBP2Q8ND30 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PPFIBP2Q8ND30 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PPFIBP2Q8ND30 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PPFIBP2Q8ND30 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PPFIBP2Q8ND30 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PPFIBP2Q8ND30 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PPFIBP2Q8ND30 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PPFIBP2Q8ND30 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PPFIBP2Q8ND30 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PPFIBP2Q8ND30 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PPFIBP2Q8ND30 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PPFIBP2Q8ND30 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PPFIBP2Q8ND30 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PPFIBP2Q8ND30 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PPFIBP2Q8ND30 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PPFIBP2Q8ND30 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPFIBP2Q8ND30 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPFIBP2Q8ND30 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPFIBP2Q8ND30 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PPFIBP2Q8ND30 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PPFIBP2Q8ND30 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PPFIBP2Q8ND30 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms