Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND24

RNF214, RING finger protein 214, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF214Q8ND24 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RNF214Q8ND24 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RNF214Q8ND24 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RNF214Q8ND24 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RNF214Q8ND24 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RNF214Q8ND24 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RNF214Q8ND24 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RNF214Q8ND24 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RNF214Q8ND24 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RNF214Q8ND24 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RNF214Q8ND24 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RNF214Q8ND24 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RNF214Q8ND24 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RNF214Q8ND24 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RNF214Q8ND24 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RNF214Q8ND24 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RNF214Q8ND24 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RNF214Q8ND24 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RNF214Q8ND24 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RNF214Q8ND24 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RNF214Q8ND24 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RNF214Q8ND24 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RNF214Q8ND24 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RNF214Q8ND24 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RNF214Q8ND24 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RNF214Q8ND24 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RNF214Q8ND24 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
RNF214Q8ND24 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RNF214Q8ND24 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RNF214Q8ND24 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RNF214Q8ND24 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RNF214Q8ND24 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RNF214Q8ND24 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RNF214Q8ND24 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RNF214Q8ND24 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RNF214Q8ND24 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
RNF214Q8ND24 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RNF214Q8ND24 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RNF214Q8ND24 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RNF214Q8ND24 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RNF214Q8ND24 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RNF214Q8ND24 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RNF214Q8ND24 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RNF214Q8ND24 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RNF214Q8ND24 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RNF214Q8ND24 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RNF214Q8ND24 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RNF214Q8ND24 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
RNF214Q8ND24 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RNF214Q8ND24 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RNF214Q8ND24 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RNF214Q8ND24 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RNF214Q8ND24 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RNF214Q8ND24 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RNF214Q8ND24 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RNF214Q8ND24 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RNF214Q8ND24 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RNF214Q8ND24 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RNF214Q8ND24 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RNF214Q8ND24 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RNF214Q8ND24 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RNF214Q8ND24 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RNF214Q8ND24 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RNF214Q8ND24 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RNF214Q8ND24 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RNF214Q8ND24 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RNF214Q8ND24 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RNF214Q8ND24 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RNF214Q8ND24 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RNF214Q8ND24 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RNF214Q8ND24 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RNF214Q8ND24 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RNF214Q8ND24 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RNF214Q8ND24 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RNF214Q8ND24 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RNF214Q8ND24 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RNF214Q8ND24 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RNF214Q8ND24 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RNF214Q8ND24 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RNF214Q8ND24 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RNF214Q8ND24 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
RNF214Q8ND24 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RNF214Q8ND24 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RNF214Q8ND24 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RNF214Q8ND24 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RNF214Q8ND24 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RNF214Q8ND24 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RNF214Q8ND24 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RNF214Q8ND24 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RNF214Q8ND24 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
RNF214Q8ND24 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
RNF214Q8ND24 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
RNF214Q8ND24 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RNF214Q8ND24 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RNF214Q8ND24 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RNF214Q8ND24 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RNF214Q8ND24 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RNF214Q8ND24 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
RNF214Q8ND24 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RNF214Q8ND24 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms