Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU1

CCDC197, Putative uncharacterized protein CCDC197, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC197Q8NCU1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC197Q8NCU1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC197Q8NCU1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC197Q8NCU1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC197Q8NCU1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC197Q8NCU1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC197Q8NCU1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC197Q8NCU1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC197Q8NCU1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC197Q8NCU1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC197Q8NCU1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC197Q8NCU1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC197Q8NCU1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC197Q8NCU1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC197Q8NCU1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC197Q8NCU1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC197Q8NCU1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC197Q8NCU1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC197Q8NCU1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC197Q8NCU1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC197Q8NCU1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC197Q8NCU1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC197Q8NCU1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC197Q8NCU1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC197Q8NCU1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC197Q8NCU1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC197Q8NCU1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC197Q8NCU1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC197Q8NCU1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC197Q8NCU1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC197Q8NCU1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC197Q8NCU1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC197Q8NCU1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC197Q8NCU1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC197Q8NCU1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC197Q8NCU1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC197Q8NCU1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC197Q8NCU1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC197Q8NCU1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC197Q8NCU1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC197Q8NCU1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC197Q8NCU1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC197Q8NCU1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC197Q8NCU1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC197Q8NCU1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC197Q8NCU1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC197Q8NCU1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC197Q8NCU1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC197Q8NCU1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC197Q8NCU1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC197Q8NCU1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC197Q8NCU1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC197Q8NCU1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC197Q8NCU1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC197Q8NCU1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC197Q8NCU1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC197Q8NCU1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC197Q8NCU1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC197Q8NCU1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC197Q8NCU1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC197Q8NCU1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC197Q8NCU1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC197Q8NCU1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC197Q8NCU1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC197Q8NCU1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC197Q8NCU1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC197Q8NCU1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC197Q8NCU1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC197Q8NCU1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC197Q8NCU1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC197Q8NCU1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC197Q8NCU1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC197Q8NCU1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC197Q8NCU1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC197Q8NCU1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC197Q8NCU1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC197Q8NCU1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC197Q8NCU1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC197Q8NCU1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC197Q8NCU1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC197Q8NCU1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC197Q8NCU1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC197Q8NCU1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC197Q8NCU1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC197Q8NCU1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC197Q8NCU1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC197Q8NCU1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC197Q8NCU1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC197Q8NCU1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC197Q8NCU1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC197Q8NCU1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC197Q8NCU1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC197Q8NCU1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC197Q8NCU1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC197Q8NCU1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC197Q8NCU1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC197Q8NCU1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC197Q8NCU1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC197Q8NCU1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC197Q8NCU1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.9 ms