Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF2

NHLRC2, NHL repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC2Q8NBF2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NHLRC2Q8NBF2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NHLRC2Q8NBF2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NHLRC2Q8NBF2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NHLRC2Q8NBF2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NHLRC2Q8NBF2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NHLRC2Q8NBF2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NHLRC2Q8NBF2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NHLRC2Q8NBF2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NHLRC2Q8NBF2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NHLRC2Q8NBF2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NHLRC2Q8NBF2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NHLRC2Q8NBF2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NHLRC2Q8NBF2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NHLRC2Q8NBF2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NHLRC2Q8NBF2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NHLRC2Q8NBF2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NHLRC2Q8NBF2 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NHLRC2Q8NBF2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NHLRC2Q8NBF2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NHLRC2Q8NBF2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NHLRC2Q8NBF2 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NHLRC2Q8NBF2 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NHLRC2Q8NBF2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NHLRC2Q8NBF2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NHLRC2Q8NBF2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NHLRC2Q8NBF2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NHLRC2Q8NBF2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NHLRC2Q8NBF2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NHLRC2Q8NBF2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NHLRC2Q8NBF2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NHLRC2Q8NBF2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NHLRC2Q8NBF2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NHLRC2Q8NBF2 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NHLRC2Q8NBF2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NHLRC2Q8NBF2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NHLRC2Q8NBF2 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NHLRC2Q8NBF2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NHLRC2Q8NBF2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NHLRC2Q8NBF2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NHLRC2Q8NBF2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NHLRC2Q8NBF2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NHLRC2Q8NBF2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NHLRC2Q8NBF2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NHLRC2Q8NBF2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NHLRC2Q8NBF2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NHLRC2Q8NBF2 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NHLRC2Q8NBF2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NHLRC2Q8NBF2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NHLRC2Q8NBF2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NHLRC2Q8NBF2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NHLRC2Q8NBF2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NHLRC2Q8NBF2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NHLRC2Q8NBF2 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NHLRC2Q8NBF2 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NHLRC2Q8NBF2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NHLRC2Q8NBF2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NHLRC2Q8NBF2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NHLRC2Q8NBF2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NHLRC2Q8NBF2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NHLRC2Q8NBF2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NHLRC2Q8NBF2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NHLRC2Q8NBF2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NHLRC2Q8NBF2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NHLRC2Q8NBF2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NHLRC2Q8NBF2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NHLRC2Q8NBF2 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NHLRC2Q8NBF2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NHLRC2Q8NBF2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NHLRC2Q8NBF2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NHLRC2Q8NBF2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NHLRC2Q8NBF2 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NHLRC2Q8NBF2 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NHLRC2Q8NBF2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NHLRC2Q8NBF2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NHLRC2Q8NBF2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NHLRC2Q8NBF2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NHLRC2Q8NBF2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NHLRC2Q8NBF2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NHLRC2Q8NBF2 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NHLRC2Q8NBF2 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NHLRC2Q8NBF2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NHLRC2Q8NBF2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NHLRC2Q8NBF2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NHLRC2Q8NBF2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NHLRC2Q8NBF2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NHLRC2Q8NBF2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NHLRC2Q8NBF2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NHLRC2Q8NBF2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NHLRC2Q8NBF2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NHLRC2Q8NBF2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NHLRC2Q8NBF2 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NHLRC2Q8NBF2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NHLRC2Q8NBF2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NHLRC2Q8NBF2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NHLRC2Q8NBF2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NHLRC2Q8NBF2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NHLRC2Q8NBF2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NHLRC2Q8NBF2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NHLRC2Q8NBF2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms