Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAT1

POMGNT2, Protein O-linked-mannose beta-1,4-N-acetylglucosaminyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMGNT2Q8NAT1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
POMGNT2Q8NAT1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
POMGNT2Q8NAT1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POMGNT2Q8NAT1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POMGNT2Q8NAT1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POMGNT2Q8NAT1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
POMGNT2Q8NAT1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POMGNT2Q8NAT1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
POMGNT2Q8NAT1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
POMGNT2Q8NAT1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
POMGNT2Q8NAT1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
POMGNT2Q8NAT1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
POMGNT2Q8NAT1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POMGNT2Q8NAT1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
POMGNT2Q8NAT1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
POMGNT2Q8NAT1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POMGNT2Q8NAT1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
POMGNT2Q8NAT1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
POMGNT2Q8NAT1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
POMGNT2Q8NAT1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
POMGNT2Q8NAT1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
POMGNT2Q8NAT1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
POMGNT2Q8NAT1 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
POMGNT2Q8NAT1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POMGNT2Q8NAT1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POMGNT2Q8NAT1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POMGNT2Q8NAT1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
POMGNT2Q8NAT1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
POMGNT2Q8NAT1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
POMGNT2Q8NAT1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POMGNT2Q8NAT1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
POMGNT2Q8NAT1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
POMGNT2Q8NAT1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
POMGNT2Q8NAT1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
POMGNT2Q8NAT1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
POMGNT2Q8NAT1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POMGNT2Q8NAT1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POMGNT2Q8NAT1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
POMGNT2Q8NAT1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POMGNT2Q8NAT1 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POMGNT2Q8NAT1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POMGNT2Q8NAT1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POMGNT2Q8NAT1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POMGNT2Q8NAT1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POMGNT2Q8NAT1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POMGNT2Q8NAT1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POMGNT2Q8NAT1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POMGNT2Q8NAT1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POMGNT2Q8NAT1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
POMGNT2Q8NAT1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
POMGNT2Q8NAT1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
POMGNT2Q8NAT1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
POMGNT2Q8NAT1 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
POMGNT2Q8NAT1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
POMGNT2Q8NAT1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POMGNT2Q8NAT1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POMGNT2Q8NAT1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POMGNT2Q8NAT1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POMGNT2Q8NAT1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POMGNT2Q8NAT1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POMGNT2Q8NAT1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POMGNT2Q8NAT1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POMGNT2Q8NAT1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POMGNT2Q8NAT1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POMGNT2Q8NAT1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POMGNT2Q8NAT1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POMGNT2Q8NAT1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POMGNT2Q8NAT1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POMGNT2Q8NAT1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POMGNT2Q8NAT1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POMGNT2Q8NAT1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POMGNT2Q8NAT1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POMGNT2Q8NAT1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POMGNT2Q8NAT1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POMGNT2Q8NAT1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POMGNT2Q8NAT1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POMGNT2Q8NAT1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
POMGNT2Q8NAT1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POMGNT2Q8NAT1 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POMGNT2Q8NAT1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POMGNT2Q8NAT1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POMGNT2Q8NAT1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POMGNT2Q8NAT1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POMGNT2Q8NAT1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
POMGNT2Q8NAT1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
POMGNT2Q8NAT1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
POMGNT2Q8NAT1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
POMGNT2Q8NAT1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
POMGNT2Q8NAT1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
POMGNT2Q8NAT1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
POMGNT2Q8NAT1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POMGNT2Q8NAT1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POMGNT2Q8NAT1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POMGNT2Q8NAT1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POMGNT2Q8NAT1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POMGNT2Q8NAT1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POMGNT2Q8NAT1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POMGNT2Q8NAT1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
POMGNT2Q8NAT1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POMGNT2Q8NAT1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms