Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8Q9

NIPA2, Magnesium transporter NIPA2, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPA2Q8N8Q9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NIPA2Q8N8Q9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NIPA2Q8N8Q9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NIPA2Q8N8Q9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NIPA2Q8N8Q9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NIPA2Q8N8Q9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NIPA2Q8N8Q9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NIPA2Q8N8Q9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NIPA2Q8N8Q9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NIPA2Q8N8Q9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NIPA2Q8N8Q9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NIPA2Q8N8Q9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NIPA2Q8N8Q9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NIPA2Q8N8Q9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NIPA2Q8N8Q9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NIPA2Q8N8Q9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NIPA2Q8N8Q9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NIPA2Q8N8Q9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NIPA2Q8N8Q9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NIPA2Q8N8Q9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NIPA2Q8N8Q9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NIPA2Q8N8Q9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NIPA2Q8N8Q9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NIPA2Q8N8Q9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NIPA2Q8N8Q9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NIPA2Q8N8Q9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NIPA2Q8N8Q9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NIPA2Q8N8Q9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NIPA2Q8N8Q9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NIPA2Q8N8Q9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NIPA2Q8N8Q9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NIPA2Q8N8Q9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NIPA2Q8N8Q9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NIPA2Q8N8Q9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NIPA2Q8N8Q9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NIPA2Q8N8Q9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NIPA2Q8N8Q9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NIPA2Q8N8Q9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NIPA2Q8N8Q9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NIPA2Q8N8Q9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NIPA2Q8N8Q9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NIPA2Q8N8Q9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NIPA2Q8N8Q9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NIPA2Q8N8Q9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NIPA2Q8N8Q9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NIPA2Q8N8Q9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NIPA2Q8N8Q9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NIPA2Q8N8Q9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NIPA2Q8N8Q9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NIPA2Q8N8Q9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NIPA2Q8N8Q9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NIPA2Q8N8Q9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NIPA2Q8N8Q9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NIPA2Q8N8Q9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NIPA2Q8N8Q9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NIPA2Q8N8Q9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NIPA2Q8N8Q9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NIPA2Q8N8Q9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NIPA2Q8N8Q9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NIPA2Q8N8Q9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NIPA2Q8N8Q9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NIPA2Q8N8Q9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NIPA2Q8N8Q9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NIPA2Q8N8Q9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NIPA2Q8N8Q9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NIPA2Q8N8Q9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NIPA2Q8N8Q9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NIPA2Q8N8Q9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NIPA2Q8N8Q9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NIPA2Q8N8Q9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NIPA2Q8N8Q9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NIPA2Q8N8Q9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NIPA2Q8N8Q9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NIPA2Q8N8Q9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NIPA2Q8N8Q9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NIPA2Q8N8Q9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NIPA2Q8N8Q9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NIPA2Q8N8Q9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NIPA2Q8N8Q9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NIPA2Q8N8Q9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NIPA2Q8N8Q9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NIPA2Q8N8Q9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NIPA2Q8N8Q9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NIPA2Q8N8Q9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NIPA2Q8N8Q9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NIPA2Q8N8Q9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NIPA2Q8N8Q9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NIPA2Q8N8Q9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NIPA2Q8N8Q9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NIPA2Q8N8Q9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NIPA2Q8N8Q9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NIPA2Q8N8Q9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NIPA2Q8N8Q9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NIPA2Q8N8Q9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NIPA2Q8N8Q9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NIPA2Q8N8Q9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NIPA2Q8N8Q9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NIPA2Q8N8Q9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NIPA2Q8N8Q9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NIPA2Q8N8Q9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms