Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Y2

LRRC17, Leucine-rich repeat-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC17Q8N6Y2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC17Q8N6Y2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC17Q8N6Y2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC17Q8N6Y2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC17Q8N6Y2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC17Q8N6Y2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC17Q8N6Y2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC17Q8N6Y2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC17Q8N6Y2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC17Q8N6Y2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC17Q8N6Y2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC17Q8N6Y2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC17Q8N6Y2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC17Q8N6Y2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC17Q8N6Y2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC17Q8N6Y2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC17Q8N6Y2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC17Q8N6Y2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC17Q8N6Y2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC17Q8N6Y2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC17Q8N6Y2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC17Q8N6Y2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC17Q8N6Y2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC17Q8N6Y2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC17Q8N6Y2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC17Q8N6Y2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC17Q8N6Y2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC17Q8N6Y2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC17Q8N6Y2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC17Q8N6Y2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC17Q8N6Y2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC17Q8N6Y2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC17Q8N6Y2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC17Q8N6Y2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC17Q8N6Y2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC17Q8N6Y2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC17Q8N6Y2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC17Q8N6Y2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC17Q8N6Y2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC17Q8N6Y2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC17Q8N6Y2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC17Q8N6Y2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC17Q8N6Y2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC17Q8N6Y2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC17Q8N6Y2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC17Q8N6Y2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC17Q8N6Y2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC17Q8N6Y2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC17Q8N6Y2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC17Q8N6Y2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC17Q8N6Y2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC17Q8N6Y2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC17Q8N6Y2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRC17Q8N6Y2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRC17Q8N6Y2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRC17Q8N6Y2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRC17Q8N6Y2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRC17Q8N6Y2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRC17Q8N6Y2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRC17Q8N6Y2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRC17Q8N6Y2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRC17Q8N6Y2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRC17Q8N6Y2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRC17Q8N6Y2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRC17Q8N6Y2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRC17Q8N6Y2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRC17Q8N6Y2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRC17Q8N6Y2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRC17Q8N6Y2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRC17Q8N6Y2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRC17Q8N6Y2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRC17Q8N6Y2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRC17Q8N6Y2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRC17Q8N6Y2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRC17Q8N6Y2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRC17Q8N6Y2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRC17Q8N6Y2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRC17Q8N6Y2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRC17Q8N6Y2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRC17Q8N6Y2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRC17Q8N6Y2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRC17Q8N6Y2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRC17Q8N6Y2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRC17Q8N6Y2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRC17Q8N6Y2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRC17Q8N6Y2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRC17Q8N6Y2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRC17Q8N6Y2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRC17Q8N6Y2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRC17Q8N6Y2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRC17Q8N6Y2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRC17Q8N6Y2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRC17Q8N6Y2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LRRC17Q8N6Y2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LRRC17Q8N6Y2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LRRC17Q8N6Y2 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LRRC17Q8N6Y2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRC17Q8N6Y2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRC17Q8N6Y2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRC17Q8N6Y2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms