Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Q1

TMCO5A, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO5AQ8N6Q1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMCO5AQ8N6Q1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMCO5AQ8N6Q1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMCO5AQ8N6Q1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMCO5AQ8N6Q1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMCO5AQ8N6Q1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMCO5AQ8N6Q1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMCO5AQ8N6Q1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMCO5AQ8N6Q1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMCO5AQ8N6Q1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TMCO5AQ8N6Q1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMCO5AQ8N6Q1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMCO5AQ8N6Q1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMCO5AQ8N6Q1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMCO5AQ8N6Q1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMCO5AQ8N6Q1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMCO5AQ8N6Q1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMCO5AQ8N6Q1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMCO5AQ8N6Q1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMCO5AQ8N6Q1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMCO5AQ8N6Q1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMCO5AQ8N6Q1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TMCO5AQ8N6Q1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMCO5AQ8N6Q1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMCO5AQ8N6Q1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMCO5AQ8N6Q1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMCO5AQ8N6Q1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TMCO5AQ8N6Q1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMCO5AQ8N6Q1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMCO5AQ8N6Q1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMCO5AQ8N6Q1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMCO5AQ8N6Q1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMCO5AQ8N6Q1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMCO5AQ8N6Q1 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMCO5AQ8N6Q1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMCO5AQ8N6Q1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMCO5AQ8N6Q1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMCO5AQ8N6Q1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMCO5AQ8N6Q1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMCO5AQ8N6Q1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMCO5AQ8N6Q1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TMCO5AQ8N6Q1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMCO5AQ8N6Q1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMCO5AQ8N6Q1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMCO5AQ8N6Q1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMCO5AQ8N6Q1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMCO5AQ8N6Q1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMCO5AQ8N6Q1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMCO5AQ8N6Q1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMCO5AQ8N6Q1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMCO5AQ8N6Q1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMCO5AQ8N6Q1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMCO5AQ8N6Q1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMCO5AQ8N6Q1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMCO5AQ8N6Q1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TMCO5AQ8N6Q1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMCO5AQ8N6Q1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMCO5AQ8N6Q1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMCO5AQ8N6Q1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMCO5AQ8N6Q1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMCO5AQ8N6Q1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMCO5AQ8N6Q1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMCO5AQ8N6Q1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMCO5AQ8N6Q1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMCO5AQ8N6Q1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMCO5AQ8N6Q1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
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TMCO5AQ8N6Q1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMCO5AQ8N6Q1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMCO5AQ8N6Q1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMCO5AQ8N6Q1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMCO5AQ8N6Q1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMCO5AQ8N6Q1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMCO5AQ8N6Q1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMCO5AQ8N6Q1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMCO5AQ8N6Q1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMCO5AQ8N6Q1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMCO5AQ8N6Q1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMCO5AQ8N6Q1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMCO5AQ8N6Q1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMCO5AQ8N6Q1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMCO5AQ8N6Q1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMCO5AQ8N6Q1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMCO5AQ8N6Q1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMCO5AQ8N6Q1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMCO5AQ8N6Q1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMCO5AQ8N6Q1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMCO5AQ8N6Q1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMCO5AQ8N6Q1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TMCO5AQ8N6Q1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMCO5AQ8N6Q1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMCO5AQ8N6Q1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMCO5AQ8N6Q1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMCO5AQ8N6Q1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMCO5AQ8N6Q1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMCO5AQ8N6Q1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMCO5AQ8N6Q1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMCO5AQ8N6Q1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMCO5AQ8N6Q1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMCO5AQ8N6Q1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
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