Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6M0

OTUD6B, OTU domain-containing protein 6B, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD6BQ8N6M0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
OTUD6BQ8N6M0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
OTUD6BQ8N6M0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
OTUD6BQ8N6M0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
OTUD6BQ8N6M0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
OTUD6BQ8N6M0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
OTUD6BQ8N6M0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
OTUD6BQ8N6M0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
OTUD6BQ8N6M0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
OTUD6BQ8N6M0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
OTUD6BQ8N6M0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
OTUD6BQ8N6M0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
OTUD6BQ8N6M0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
OTUD6BQ8N6M0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
OTUD6BQ8N6M0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
OTUD6BQ8N6M0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
OTUD6BQ8N6M0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
OTUD6BQ8N6M0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
OTUD6BQ8N6M0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
OTUD6BQ8N6M0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
OTUD6BQ8N6M0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
OTUD6BQ8N6M0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
OTUD6BQ8N6M0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
OTUD6BQ8N6M0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
OTUD6BQ8N6M0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
OTUD6BQ8N6M0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
OTUD6BQ8N6M0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
OTUD6BQ8N6M0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
OTUD6BQ8N6M0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
OTUD6BQ8N6M0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
OTUD6BQ8N6M0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
OTUD6BQ8N6M0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
OTUD6BQ8N6M0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
OTUD6BQ8N6M0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
OTUD6BQ8N6M0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
OTUD6BQ8N6M0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
OTUD6BQ8N6M0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
OTUD6BQ8N6M0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
OTUD6BQ8N6M0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
OTUD6BQ8N6M0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
OTUD6BQ8N6M0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
OTUD6BQ8N6M0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
OTUD6BQ8N6M0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
OTUD6BQ8N6M0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
OTUD6BQ8N6M0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
OTUD6BQ8N6M0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
OTUD6BQ8N6M0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
OTUD6BQ8N6M0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
OTUD6BQ8N6M0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
OTUD6BQ8N6M0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
OTUD6BQ8N6M0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
OTUD6BQ8N6M0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
OTUD6BQ8N6M0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
OTUD6BQ8N6M0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
OTUD6BQ8N6M0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
OTUD6BQ8N6M0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
OTUD6BQ8N6M0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
OTUD6BQ8N6M0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
OTUD6BQ8N6M0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
OTUD6BQ8N6M0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
OTUD6BQ8N6M0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
OTUD6BQ8N6M0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
OTUD6BQ8N6M0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
OTUD6BQ8N6M0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
OTUD6BQ8N6M0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
OTUD6BQ8N6M0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
OTUD6BQ8N6M0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
OTUD6BQ8N6M0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
OTUD6BQ8N6M0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
OTUD6BQ8N6M0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
OTUD6BQ8N6M0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
OTUD6BQ8N6M0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
OTUD6BQ8N6M0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
OTUD6BQ8N6M0 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
OTUD6BQ8N6M0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
OTUD6BQ8N6M0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
OTUD6BQ8N6M0 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
OTUD6BQ8N6M0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
OTUD6BQ8N6M0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
OTUD6BQ8N6M0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
OTUD6BQ8N6M0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
OTUD6BQ8N6M0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
OTUD6BQ8N6M0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
OTUD6BQ8N6M0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
OTUD6BQ8N6M0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
OTUD6BQ8N6M0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
OTUD6BQ8N6M0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
OTUD6BQ8N6M0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
OTUD6BQ8N6M0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
OTUD6BQ8N6M0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
OTUD6BQ8N6M0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
OTUD6BQ8N6M0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
OTUD6BQ8N6M0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
OTUD6BQ8N6M0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
OTUD6BQ8N6M0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
OTUD6BQ8N6M0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
OTUD6BQ8N6M0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
OTUD6BQ8N6M0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
OTUD6BQ8N6M0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
OTUD6BQ8N6M0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms