Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLIP4Q8N3C7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLIP4Q8N3C7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLIP4Q8N3C7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLIP4Q8N3C7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLIP4Q8N3C7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLIP4Q8N3C7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLIP4Q8N3C7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLIP4Q8N3C7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLIP4Q8N3C7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLIP4Q8N3C7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLIP4Q8N3C7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLIP4Q8N3C7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLIP4Q8N3C7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLIP4Q8N3C7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CLIP4Q8N3C7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLIP4Q8N3C7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CLIP4Q8N3C7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLIP4Q8N3C7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLIP4Q8N3C7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLIP4Q8N3C7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLIP4Q8N3C7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLIP4Q8N3C7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLIP4Q8N3C7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CLIP4Q8N3C7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLIP4Q8N3C7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLIP4Q8N3C7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLIP4Q8N3C7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLIP4Q8N3C7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLIP4Q8N3C7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLIP4Q8N3C7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLIP4Q8N3C7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLIP4Q8N3C7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLIP4Q8N3C7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLIP4Q8N3C7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLIP4Q8N3C7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLIP4Q8N3C7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLIP4Q8N3C7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLIP4Q8N3C7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLIP4Q8N3C7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLIP4Q8N3C7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLIP4Q8N3C7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLIP4Q8N3C7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLIP4Q8N3C7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLIP4Q8N3C7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLIP4Q8N3C7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLIP4Q8N3C7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLIP4Q8N3C7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLIP4Q8N3C7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLIP4Q8N3C7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLIP4Q8N3C7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLIP4Q8N3C7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLIP4Q8N3C7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLIP4Q8N3C7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLIP4Q8N3C7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLIP4Q8N3C7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLIP4Q8N3C7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLIP4Q8N3C7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLIP4Q8N3C7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLIP4Q8N3C7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLIP4Q8N3C7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLIP4Q8N3C7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CLIP4Q8N3C7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLIP4Q8N3C7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLIP4Q8N3C7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLIP4Q8N3C7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLIP4Q8N3C7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CLIP4Q8N3C7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLIP4Q8N3C7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLIP4Q8N3C7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLIP4Q8N3C7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLIP4Q8N3C7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLIP4Q8N3C7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLIP4Q8N3C7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLIP4Q8N3C7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLIP4Q8N3C7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLIP4Q8N3C7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLIP4Q8N3C7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLIP4Q8N3C7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLIP4Q8N3C7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLIP4Q8N3C7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLIP4Q8N3C7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CLIP4Q8N3C7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLIP4Q8N3C7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLIP4Q8N3C7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLIP4Q8N3C7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLIP4Q8N3C7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLIP4Q8N3C7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLIP4Q8N3C7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLIP4Q8N3C7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLIP4Q8N3C7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLIP4Q8N3C7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLIP4Q8N3C7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLIP4Q8N3C7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLIP4Q8N3C7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLIP4Q8N3C7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLIP4Q8N3C7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLIP4Q8N3C7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLIP4Q8N3C7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLIP4Q8N3C7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms