Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXV7

KLHDC8B, Kelch domain-containing protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC8BQ8IXV7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLHDC8BQ8IXV7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KLHDC8BQ8IXV7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KLHDC8BQ8IXV7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
KLHDC8BQ8IXV7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
KLHDC8BQ8IXV7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHDC8BQ8IXV7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHDC8BQ8IXV7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHDC8BQ8IXV7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHDC8BQ8IXV7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHDC8BQ8IXV7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KLHDC8BQ8IXV7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KLHDC8BQ8IXV7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KLHDC8BQ8IXV7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KLHDC8BQ8IXV7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KLHDC8BQ8IXV7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHDC8BQ8IXV7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHDC8BQ8IXV7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHDC8BQ8IXV7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHDC8BQ8IXV7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHDC8BQ8IXV7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHDC8BQ8IXV7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHDC8BQ8IXV7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHDC8BQ8IXV7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHDC8BQ8IXV7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHDC8BQ8IXV7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHDC8BQ8IXV7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHDC8BQ8IXV7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHDC8BQ8IXV7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
KLHDC8BQ8IXV7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
KLHDC8BQ8IXV7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
KLHDC8BQ8IXV7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KLHDC8BQ8IXV7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KLHDC8BQ8IXV7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KLHDC8BQ8IXV7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLHDC8BQ8IXV7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLHDC8BQ8IXV7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHDC8BQ8IXV7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHDC8BQ8IXV7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHDC8BQ8IXV7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHDC8BQ8IXV7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHDC8BQ8IXV7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHDC8BQ8IXV7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHDC8BQ8IXV7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHDC8BQ8IXV7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHDC8BQ8IXV7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHDC8BQ8IXV7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHDC8BQ8IXV7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHDC8BQ8IXV7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHDC8BQ8IXV7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHDC8BQ8IXV7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHDC8BQ8IXV7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHDC8BQ8IXV7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHDC8BQ8IXV7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHDC8BQ8IXV7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHDC8BQ8IXV7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHDC8BQ8IXV7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
KLHDC8BQ8IXV7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KLHDC8BQ8IXV7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
KLHDC8BQ8IXV7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
KLHDC8BQ8IXV7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KLHDC8BQ8IXV7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KLHDC8BQ8IXV7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHDC8BQ8IXV7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHDC8BQ8IXV7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHDC8BQ8IXV7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHDC8BQ8IXV7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHDC8BQ8IXV7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHDC8BQ8IXV7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHDC8BQ8IXV7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHDC8BQ8IXV7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHDC8BQ8IXV7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHDC8BQ8IXV7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHDC8BQ8IXV7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHDC8BQ8IXV7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHDC8BQ8IXV7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHDC8BQ8IXV7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHDC8BQ8IXV7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHDC8BQ8IXV7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHDC8BQ8IXV7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KLHDC8BQ8IXV7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KLHDC8BQ8IXV7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KLHDC8BQ8IXV7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KLHDC8BQ8IXV7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KLHDC8BQ8IXV7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KLHDC8BQ8IXV7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHDC8BQ8IXV7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHDC8BQ8IXV7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHDC8BQ8IXV7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHDC8BQ8IXV7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHDC8BQ8IXV7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHDC8BQ8IXV7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHDC8BQ8IXV7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHDC8BQ8IXV7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHDC8BQ8IXV7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHDC8BQ8IXV7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHDC8BQ8IXV7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHDC8BQ8IXV7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHDC8BQ8IXV7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHDC8BQ8IXV7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms