Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC117Q8IWD4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC117Q8IWD4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC117Q8IWD4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC117Q8IWD4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC117Q8IWD4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC117Q8IWD4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC117Q8IWD4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC117Q8IWD4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC117Q8IWD4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC117Q8IWD4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC117Q8IWD4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC117Q8IWD4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC117Q8IWD4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC117Q8IWD4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC117Q8IWD4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC117Q8IWD4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC117Q8IWD4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC117Q8IWD4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC117Q8IWD4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC117Q8IWD4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC117Q8IWD4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC117Q8IWD4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC117Q8IWD4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC117Q8IWD4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC117Q8IWD4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC117Q8IWD4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC117Q8IWD4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC117Q8IWD4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC117Q8IWD4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC117Q8IWD4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC117Q8IWD4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC117Q8IWD4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC117Q8IWD4 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC117Q8IWD4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC117Q8IWD4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC117Q8IWD4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC117Q8IWD4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC117Q8IWD4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC117Q8IWD4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC117Q8IWD4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC117Q8IWD4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC117Q8IWD4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC117Q8IWD4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC117Q8IWD4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC117Q8IWD4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC117Q8IWD4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC117Q8IWD4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC117Q8IWD4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC117Q8IWD4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CCDC117Q8IWD4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC117Q8IWD4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC117Q8IWD4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC117Q8IWD4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC117Q8IWD4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC117Q8IWD4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC117Q8IWD4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC117Q8IWD4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC117Q8IWD4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC117Q8IWD4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC117Q8IWD4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC117Q8IWD4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC117Q8IWD4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC117Q8IWD4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC117Q8IWD4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC117Q8IWD4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC117Q8IWD4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC117Q8IWD4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC117Q8IWD4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC117Q8IWD4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC117Q8IWD4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC117Q8IWD4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC117Q8IWD4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC117Q8IWD4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC117Q8IWD4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC117Q8IWD4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC117Q8IWD4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC117Q8IWD4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC117Q8IWD4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC117Q8IWD4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC117Q8IWD4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC117Q8IWD4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC117Q8IWD4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC117Q8IWD4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC117Q8IWD4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC117Q8IWD4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC117Q8IWD4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC117Q8IWD4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC117Q8IWD4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC117Q8IWD4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC117Q8IWD4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC117Q8IWD4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC117Q8IWD4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC117Q8IWD4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC117Q8IWD4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC117Q8IWD4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC117Q8IWD4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC117Q8IWD4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC117Q8IWD4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC117Q8IWD4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms