Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW19

APLF, Aprataxin and PNK-like factor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APLFQ8IW19 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
APLFQ8IW19 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
APLFQ8IW19 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
APLFQ8IW19 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
APLFQ8IW19 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
APLFQ8IW19 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
APLFQ8IW19 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
APLFQ8IW19 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
APLFQ8IW19 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
APLFQ8IW19 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
APLFQ8IW19 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
APLFQ8IW19 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
APLFQ8IW19 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
APLFQ8IW19 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
APLFQ8IW19 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
APLFQ8IW19 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
APLFQ8IW19 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
APLFQ8IW19 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
APLFQ8IW19 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
APLFQ8IW19 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
APLFQ8IW19 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
APLFQ8IW19 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
APLFQ8IW19 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
APLFQ8IW19 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
APLFQ8IW19 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
APLFQ8IW19 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
APLFQ8IW19 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
APLFQ8IW19 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
APLFQ8IW19 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
APLFQ8IW19 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
APLFQ8IW19 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
APLFQ8IW19 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
APLFQ8IW19 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
APLFQ8IW19 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
APLFQ8IW19 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
APLFQ8IW19 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
APLFQ8IW19 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
APLFQ8IW19 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
APLFQ8IW19 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
APLFQ8IW19 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
APLFQ8IW19 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
APLFQ8IW19 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
APLFQ8IW19 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
APLFQ8IW19 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
APLFQ8IW19 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
APLFQ8IW19 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
APLFQ8IW19 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
APLFQ8IW19 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
APLFQ8IW19 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
APLFQ8IW19 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
APLFQ8IW19 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
APLFQ8IW19 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
APLFQ8IW19 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
APLFQ8IW19 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APLFQ8IW19 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APLFQ8IW19 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
APLFQ8IW19 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
APLFQ8IW19 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APLFQ8IW19 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APLFQ8IW19 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
APLFQ8IW19 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
APLFQ8IW19 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APLFQ8IW19 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
APLFQ8IW19 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APLFQ8IW19 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
APLFQ8IW19 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
APLFQ8IW19 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
APLFQ8IW19 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
APLFQ8IW19 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
APLFQ8IW19 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
APLFQ8IW19 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
APLFQ8IW19 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
APLFQ8IW19 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
APLFQ8IW19 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
APLFQ8IW19 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
APLFQ8IW19 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
APLFQ8IW19 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
APLFQ8IW19 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
APLFQ8IW19 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
APLFQ8IW19 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
APLFQ8IW19 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
APLFQ8IW19 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
APLFQ8IW19 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
APLFQ8IW19 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
APLFQ8IW19 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
APLFQ8IW19 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APLFQ8IW19 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APLFQ8IW19 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APLFQ8IW19 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
APLFQ8IW19 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APLFQ8IW19 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APLFQ8IW19 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APLFQ8IW19 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
APLFQ8IW19 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
APLFQ8IW19 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
APLFQ8IW19 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APLFQ8IW19 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APLFQ8IW19 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
APLFQ8IW19 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
APLFQ8IW19 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms