Protein–RNA interactions for Protein: Q86X52

CHSY1, Chondroitin sulfate synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHSY1Q86X52 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHSY1Q86X52 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHSY1Q86X52 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHSY1Q86X52 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CHSY1Q86X52 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHSY1Q86X52 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHSY1Q86X52 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHSY1Q86X52 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHSY1Q86X52 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHSY1Q86X52 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHSY1Q86X52 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CHSY1Q86X52 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHSY1Q86X52 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CHSY1Q86X52 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHSY1Q86X52 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHSY1Q86X52 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CHSY1Q86X52 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHSY1Q86X52 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHSY1Q86X52 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHSY1Q86X52 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHSY1Q86X52 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHSY1Q86X52 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHSY1Q86X52 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHSY1Q86X52 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHSY1Q86X52 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHSY1Q86X52 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHSY1Q86X52 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHSY1Q86X52 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHSY1Q86X52 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHSY1Q86X52 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHSY1Q86X52 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHSY1Q86X52 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHSY1Q86X52 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHSY1Q86X52 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHSY1Q86X52 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHSY1Q86X52 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHSY1Q86X52 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHSY1Q86X52 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHSY1Q86X52 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHSY1Q86X52 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHSY1Q86X52 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHSY1Q86X52 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHSY1Q86X52 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CHSY1Q86X52 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHSY1Q86X52 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHSY1Q86X52 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CHSY1Q86X52 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHSY1Q86X52 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHSY1Q86X52 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHSY1Q86X52 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHSY1Q86X52 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHSY1Q86X52 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CHSY1Q86X52 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CHSY1Q86X52 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CHSY1Q86X52 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHSY1Q86X52 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHSY1Q86X52 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHSY1Q86X52 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHSY1Q86X52 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHSY1Q86X52 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHSY1Q86X52 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHSY1Q86X52 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHSY1Q86X52 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHSY1Q86X52 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHSY1Q86X52 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHSY1Q86X52 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHSY1Q86X52 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CHSY1Q86X52 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHSY1Q86X52 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHSY1Q86X52 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHSY1Q86X52 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHSY1Q86X52 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHSY1Q86X52 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHSY1Q86X52 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHSY1Q86X52 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHSY1Q86X52 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHSY1Q86X52 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHSY1Q86X52 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHSY1Q86X52 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHSY1Q86X52 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHSY1Q86X52 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHSY1Q86X52 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHSY1Q86X52 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHSY1Q86X52 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHSY1Q86X52 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHSY1Q86X52 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHSY1Q86X52 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHSY1Q86X52 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHSY1Q86X52 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CHSY1Q86X52 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CHSY1Q86X52 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHSY1Q86X52 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHSY1Q86X52 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHSY1Q86X52 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHSY1Q86X52 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHSY1Q86X52 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHSY1Q86X52 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHSY1Q86X52 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CHSY1Q86X52 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHSY1Q86X52 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms