Protein–RNA interactions for Protein: Q86W54

SPATA24, Spermatogenesis-associated protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA24Q86W54 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPATA24Q86W54 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPATA24Q86W54 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPATA24Q86W54 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SPATA24Q86W54 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPATA24Q86W54 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPATA24Q86W54 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SPATA24Q86W54 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPATA24Q86W54 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPATA24Q86W54 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SPATA24Q86W54 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPATA24Q86W54 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPATA24Q86W54 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPATA24Q86W54 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SPATA24Q86W54 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SPATA24Q86W54 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SPATA24Q86W54 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPATA24Q86W54 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPATA24Q86W54 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPATA24Q86W54 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPATA24Q86W54 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPATA24Q86W54 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPATA24Q86W54 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPATA24Q86W54 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPATA24Q86W54 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPATA24Q86W54 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SPATA24Q86W54 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPATA24Q86W54 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPATA24Q86W54 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPATA24Q86W54 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SPATA24Q86W54 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPATA24Q86W54 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPATA24Q86W54 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPATA24Q86W54 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPATA24Q86W54 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPATA24Q86W54 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPATA24Q86W54 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPATA24Q86W54 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SPATA24Q86W54 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPATA24Q86W54 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPATA24Q86W54 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPATA24Q86W54 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPATA24Q86W54 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPATA24Q86W54 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPATA24Q86W54 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPATA24Q86W54 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPATA24Q86W54 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPATA24Q86W54 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPATA24Q86W54 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPATA24Q86W54 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPATA24Q86W54 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPATA24Q86W54 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPATA24Q86W54 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPATA24Q86W54 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SPATA24Q86W54 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPATA24Q86W54 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SPATA24Q86W54 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SPATA24Q86W54 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPATA24Q86W54 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPATA24Q86W54 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPATA24Q86W54 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPATA24Q86W54 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPATA24Q86W54 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPATA24Q86W54 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPATA24Q86W54 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPATA24Q86W54 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPATA24Q86W54 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPATA24Q86W54 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPATA24Q86W54 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPATA24Q86W54 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPATA24Q86W54 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPATA24Q86W54 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPATA24Q86W54 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPATA24Q86W54 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPATA24Q86W54 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SPATA24Q86W54 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SPATA24Q86W54 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPATA24Q86W54 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPATA24Q86W54 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPATA24Q86W54 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPATA24Q86W54 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPATA24Q86W54 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPATA24Q86W54 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPATA24Q86W54 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SPATA24Q86W54 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPATA24Q86W54 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPATA24Q86W54 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPATA24Q86W54 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPATA24Q86W54 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPATA24Q86W54 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPATA24Q86W54 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPATA24Q86W54 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPATA24Q86W54 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPATA24Q86W54 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPATA24Q86W54 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPATA24Q86W54 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPATA24Q86W54 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SPATA24Q86W54 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPATA24Q86W54 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPATA24Q86W54 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms