Protein–RNA interactions for Protein: Q86VQ0

LCA5, Lebercilin, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCA5Q86VQ0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LCA5Q86VQ0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LCA5Q86VQ0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LCA5Q86VQ0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LCA5Q86VQ0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LCA5Q86VQ0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LCA5Q86VQ0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LCA5Q86VQ0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LCA5Q86VQ0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
LCA5Q86VQ0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
LCA5Q86VQ0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
LCA5Q86VQ0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LCA5Q86VQ0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LCA5Q86VQ0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LCA5Q86VQ0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
LCA5Q86VQ0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LCA5Q86VQ0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LCA5Q86VQ0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LCA5Q86VQ0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LCA5Q86VQ0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LCA5Q86VQ0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LCA5Q86VQ0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LCA5Q86VQ0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LCA5Q86VQ0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LCA5Q86VQ0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LCA5Q86VQ0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LCA5Q86VQ0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LCA5Q86VQ0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LCA5Q86VQ0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LCA5Q86VQ0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LCA5Q86VQ0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LCA5Q86VQ0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LCA5Q86VQ0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LCA5Q86VQ0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LCA5Q86VQ0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LCA5Q86VQ0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LCA5Q86VQ0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LCA5Q86VQ0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LCA5Q86VQ0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LCA5Q86VQ0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LCA5Q86VQ0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LCA5Q86VQ0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LCA5Q86VQ0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LCA5Q86VQ0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LCA5Q86VQ0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LCA5Q86VQ0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LCA5Q86VQ0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LCA5Q86VQ0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LCA5Q86VQ0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LCA5Q86VQ0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LCA5Q86VQ0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LCA5Q86VQ0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LCA5Q86VQ0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LCA5Q86VQ0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LCA5Q86VQ0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LCA5Q86VQ0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LCA5Q86VQ0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LCA5Q86VQ0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LCA5Q86VQ0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LCA5Q86VQ0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LCA5Q86VQ0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
LCA5Q86VQ0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LCA5Q86VQ0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LCA5Q86VQ0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LCA5Q86VQ0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LCA5Q86VQ0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LCA5Q86VQ0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LCA5Q86VQ0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LCA5Q86VQ0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LCA5Q86VQ0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LCA5Q86VQ0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LCA5Q86VQ0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
LCA5Q86VQ0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LCA5Q86VQ0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LCA5Q86VQ0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LCA5Q86VQ0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LCA5Q86VQ0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LCA5Q86VQ0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
LCA5Q86VQ0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LCA5Q86VQ0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LCA5Q86VQ0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LCA5Q86VQ0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LCA5Q86VQ0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LCA5Q86VQ0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LCA5Q86VQ0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LCA5Q86VQ0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LCA5Q86VQ0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LCA5Q86VQ0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LCA5Q86VQ0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LCA5Q86VQ0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LCA5Q86VQ0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LCA5Q86VQ0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LCA5Q86VQ0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LCA5Q86VQ0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LCA5Q86VQ0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
LCA5Q86VQ0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
LCA5Q86VQ0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LCA5Q86VQ0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LCA5Q86VQ0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LCA5Q86VQ0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms