Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y8

KRT27, Keratin, type I cytoskeletal 27, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT27Q7Z3Y8 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
KRT27Q7Z3Y8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
KRT27Q7Z3Y8 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
KRT27Q7Z3Y8 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
KRT27Q7Z3Y8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
KRT27Q7Z3Y8 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
KRT27Q7Z3Y8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC32.29■■■□□ 2.76
KRT27Q7Z3Y8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
KRT27Q7Z3Y8 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
KRT27Q7Z3Y8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
KRT27Q7Z3Y8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
KRT27Q7Z3Y8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
KRT27Q7Z3Y8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
KRT27Q7Z3Y8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
KRT27Q7Z3Y8 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
KRT27Q7Z3Y8 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
KRT27Q7Z3Y8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
KRT27Q7Z3Y8 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
KRT27Q7Z3Y8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
KRT27Q7Z3Y8 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
KRT27Q7Z3Y8 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
KRT27Q7Z3Y8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
KRT27Q7Z3Y8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
KRT27Q7Z3Y8 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
KRT27Q7Z3Y8 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
KRT27Q7Z3Y8 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
KRT27Q7Z3Y8 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
KRT27Q7Z3Y8 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
KRT27Q7Z3Y8 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
KRT27Q7Z3Y8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
KRT27Q7Z3Y8 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
KRT27Q7Z3Y8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
KRT27Q7Z3Y8 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
KRT27Q7Z3Y8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
KRT27Q7Z3Y8 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
KRT27Q7Z3Y8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
KRT27Q7Z3Y8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
KRT27Q7Z3Y8 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
KRT27Q7Z3Y8 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC32.2■■■□□ 2.75
KRT27Q7Z3Y8 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
KRT27Q7Z3Y8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
KRT27Q7Z3Y8 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
KRT27Q7Z3Y8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
KRT27Q7Z3Y8 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
KRT27Q7Z3Y8 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
KRT27Q7Z3Y8 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
KRT27Q7Z3Y8 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
KRT27Q7Z3Y8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
KRT27Q7Z3Y8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
KRT27Q7Z3Y8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
KRT27Q7Z3Y8 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
KRT27Q7Z3Y8 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
KRT27Q7Z3Y8 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
KRT27Q7Z3Y8 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
KRT27Q7Z3Y8 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
KRT27Q7Z3Y8 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
KRT27Q7Z3Y8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
KRT27Q7Z3Y8 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
KRT27Q7Z3Y8 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
KRT27Q7Z3Y8 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
KRT27Q7Z3Y8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
KRT27Q7Z3Y8 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
KRT27Q7Z3Y8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
KRT27Q7Z3Y8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
KRT27Q7Z3Y8 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
KRT27Q7Z3Y8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
KRT27Q7Z3Y8 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
KRT27Q7Z3Y8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
KRT27Q7Z3Y8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
KRT27Q7Z3Y8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
KRT27Q7Z3Y8 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC32.11■■■□□ 2.73
KRT27Q7Z3Y8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
KRT27Q7Z3Y8 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
KRT27Q7Z3Y8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
KRT27Q7Z3Y8 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
KRT27Q7Z3Y8 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
KRT27Q7Z3Y8 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
KRT27Q7Z3Y8 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
KRT27Q7Z3Y8 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
KRT27Q7Z3Y8 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
KRT27Q7Z3Y8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
KRT27Q7Z3Y8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
KRT27Q7Z3Y8 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
KRT27Q7Z3Y8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
KRT27Q7Z3Y8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
KRT27Q7Z3Y8 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
KRT27Q7Z3Y8 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
KRT27Q7Z3Y8 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
KRT27Q7Z3Y8 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
KRT27Q7Z3Y8 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
KRT27Q7Z3Y8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
KRT27Q7Z3Y8 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
KRT27Q7Z3Y8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
KRT27Q7Z3Y8 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
KRT27Q7Z3Y8 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
KRT27Q7Z3Y8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
KRT27Q7Z3Y8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
KRT27Q7Z3Y8 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
KRT27Q7Z3Y8 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
KRT27Q7Z3Y8 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms