Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Q1

SLC46A3, Solute carrier family 46 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC46A3Q7Z3Q1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC46A3Q7Z3Q1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC46A3Q7Z3Q1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC46A3Q7Z3Q1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC46A3Q7Z3Q1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC46A3Q7Z3Q1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC46A3Q7Z3Q1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC46A3Q7Z3Q1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC46A3Q7Z3Q1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC46A3Q7Z3Q1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC46A3Q7Z3Q1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC46A3Q7Z3Q1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC46A3Q7Z3Q1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC46A3Q7Z3Q1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC46A3Q7Z3Q1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC46A3Q7Z3Q1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC46A3Q7Z3Q1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC46A3Q7Z3Q1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC46A3Q7Z3Q1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC46A3Q7Z3Q1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC46A3Q7Z3Q1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC46A3Q7Z3Q1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC46A3Q7Z3Q1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC46A3Q7Z3Q1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC46A3Q7Z3Q1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC46A3Q7Z3Q1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC46A3Q7Z3Q1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC46A3Q7Z3Q1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC46A3Q7Z3Q1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC46A3Q7Z3Q1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC46A3Q7Z3Q1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC46A3Q7Z3Q1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC46A3Q7Z3Q1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC46A3Q7Z3Q1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC46A3Q7Z3Q1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC46A3Q7Z3Q1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC46A3Q7Z3Q1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC46A3Q7Z3Q1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC46A3Q7Z3Q1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC46A3Q7Z3Q1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC46A3Q7Z3Q1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC46A3Q7Z3Q1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC46A3Q7Z3Q1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC46A3Q7Z3Q1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC46A3Q7Z3Q1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC46A3Q7Z3Q1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC46A3Q7Z3Q1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC46A3Q7Z3Q1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC46A3Q7Z3Q1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC46A3Q7Z3Q1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC46A3Q7Z3Q1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC46A3Q7Z3Q1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC46A3Q7Z3Q1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC46A3Q7Z3Q1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC46A3Q7Z3Q1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC46A3Q7Z3Q1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC46A3Q7Z3Q1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC46A3Q7Z3Q1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC46A3Q7Z3Q1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC46A3Q7Z3Q1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC46A3Q7Z3Q1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC46A3Q7Z3Q1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC46A3Q7Z3Q1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC46A3Q7Z3Q1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC46A3Q7Z3Q1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC46A3Q7Z3Q1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC46A3Q7Z3Q1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC46A3Q7Z3Q1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC46A3Q7Z3Q1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC46A3Q7Z3Q1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC46A3Q7Z3Q1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC46A3Q7Z3Q1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC46A3Q7Z3Q1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC46A3Q7Z3Q1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC46A3Q7Z3Q1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC46A3Q7Z3Q1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC46A3Q7Z3Q1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC46A3Q7Z3Q1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC46A3Q7Z3Q1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC46A3Q7Z3Q1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC46A3Q7Z3Q1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC46A3Q7Z3Q1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC46A3Q7Z3Q1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC46A3Q7Z3Q1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC46A3Q7Z3Q1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC46A3Q7Z3Q1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC46A3Q7Z3Q1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC46A3Q7Z3Q1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC46A3Q7Z3Q1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC46A3Q7Z3Q1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC46A3Q7Z3Q1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC46A3Q7Z3Q1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC46A3Q7Z3Q1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC46A3Q7Z3Q1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC46A3Q7Z3Q1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC46A3Q7Z3Q1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC46A3Q7Z3Q1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC46A3Q7Z3Q1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC46A3Q7Z3Q1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC46A3Q7Z3Q1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms